Pesquisa | BVS Violência e Saúde

1.

Whole-Genome Sequencing of a Healthy Aging Cohort.

Erikson, Galina A; Bodian, Dale L; Rueda, Manuel; Molparia, Bhuvan; Scott, Erick R; Scott-Van Zeeland, Ashley A; Topol, Sarah E; Wineinger, Nathan E; Niederhuber, John E; Topol, Eric J; Torkamani, Ali.

Cell ; 165(4): 1002-11, 2016 May 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27114037

2.

A quality control portal for sequencing data deposited at the European genome-phenome archive.

Fernández-Orth, Dietmar; Rueda, Manuel; Singh, Babita; Moldes, Mauricio; Jene, Aina; Ferri, Marta; Vasallo, Claudia; Fromont, Lauren A; Navarro, Arcadi; Rambla, Jordi.

Brief Bioinform ; 23(3)2022 05 13.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35438138

3.

Convert-Pheno: A software toolkit for the interconversion of standard data models for phenotypic data.

Rueda, Manuel; Leist, Ivo C; Gut, Ivo G.

J Biomed Inform ; 149: 104558, 2024 Jan.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38035971

4.

The European Genome-phenome Archive in 2021.

Freeberg, Mallory Ann; Fromont, Lauren A; D'Altri, Teresa; Romero, Anna Foix; Ciges, Jorge Izquierdo; Jene, Aina; Kerry, Giselle; Moldes, Mauricio; Ariosa, Roberto; Bahena, Silvia; Barrowdale, Daniel; Barbero, Marcos Casado; Fernandez-Orth, Dietmar; Garcia-Linares, Carles; Garcia-Rios, Emilio; Haziza, Frédéric; Juhasz, Bela; Llobet, Oscar Martinez; Milla, Gemma; Mohan, Anand; Rueda, Manuel; Sankar, Aravind; Shaju, Dona; Shimpi, Ashutosh; Singh, Babita; Thomas, Coline; de la Torre, Sabela; Uyan, Umuthan; Vasallo, Claudia; Flicek, Paul; Guigo, Roderic; Navarro, Arcadi; Parkinson, Helen; Keane, Thomas; Rambla, Jordi.

Nucleic Acids Res ; 50(D1): D980-D987, 2022 01 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34791407

5.

Beacon v2 Reference Implementation: a toolkit to enable federated sharing of genomic and phenotypic data.

Rueda, Manuel; Ariosa, Roberto; Moldes, Mauricio; Rambla, Jordi.

Bioinformatics ; 38(19): 4656-4657, 2022 09 30.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35980167

6.

Beacon v2 and Beacon networks: A "lingua franca" for federated data discovery in biomedical genomics, and beyond.

Rambla, Jordi; Baudis, Michael; Ariosa, Roberto; Beck, Tim; Fromont, Lauren A; Navarro, Arcadi; Paloots, Rahel; Rueda, Manuel; Saunders, Gary; Singh, Babita; Spalding, John D; Törnroos, Juha; Vasallo, Claudia; Veal, Colin D; Brookes, Anthony J.

Hum Mutat ; 43(6): 791-799, 2022 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35297548

7.

Gene expression profiles of beta-adrenergic receptors in canine vascular tumors: a preliminary study.

Clanxet, Jordi; Teles, Mariana; Hernández-Losa, Javier; Rueda, Manuel Ruiz-Echarri; Benitez-Fusté, Luis; Pastor, Josep.

BMC Vet Res ; 18(1): 206, 2022 May 30.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35637463

8.

Preoperative Use of Intra-Aortic Balloon Pump Support Reduced 30-Day Mortality in a Population with LVEF >35% and High Surgical Risk after Coronary Artery Bypass Graft Surgery.

Escutia-Cuevas, Héctor Hugo; Suárez-Cuenca, Juan Antonio; Espinoza-Rueda, Manuel Armando; Macedo-Calvillo, Lecsy; Castro-Gutiérrez, Armando; García-García, Juan Francisco; García-Ortegón, Maria Del Sol; Robledo, Rogelio; Mondragón-Terán, Paul.

Cardiology ; 145(5): 267-274, 2020.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32222708

9.

SG-ADVISER mtDNA: a web server for mitochondrial DNA annotation with data from 200 samples of a healthy aging cohort.

Rueda, Manuel; Torkamani, Ali.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 373, 2017 Aug 18.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28821228

10.

Mutation of WIF1: a potential novel cause of a Nail-Patella-like disorder.

Jones, Marilyn C; Topol, Sarah E; Rueda, Manuel; Oliveira, Glenn; Phillips, Tierney; Spencer, Emily G; Torkamani, Ali.

Genet Med ; 19(10): 1179-1183, 2017 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28383544

11.

From Homology Models to a Set of Predictive Binding Pockets-a 5-HT_1A Receptor Case Study.

Warszycki, Dawid; Rueda, Manuel; Mordalski, Stefan; Kristiansen, Kurt; Satala, Grzegorz; Rataj, Krzysztof; Chilmonczyk, Zdzislaw; Sylte, Ingebrigt; Abagyan, Ruben; Bojarski, Andrzej J.

J Chem Inf Model ; 57(2): 311-321, 2017 02 27.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28055203

12.

Exploring early stages of the chemical unfolding of proteins at the proteome scale.

Candotti, Michela; Pérez, Alberto; Ferrer-Costa, Carles; Rueda, Manuel; Meyer, Tim; Gelpí, Josep Lluís; Orozco, Modesto.

PLoS Comput Biol ; 9(12): e1003393, 2013.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24348236

13.

The Green Helmets: providing care in Venezuela's protests.

Rueda, Manuel.

Lancet ; 390(10094): 543-544, 2017 08 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28792387

14.

BioSuper: a web tool for the superimposition of biomolecules and assemblies with rotational symmetry.

Rueda, Manuel; Orozco, Modesto; Totrov, Maxim; Abagyan, Ruben.

BMC Struct Biol ; 13: 32, 2013 Dec 13.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24330655

15.

ALiBERO: evolving a team of complementary pocket conformations rather than a single leader.

Rueda, Manuel; Totrov, Max; Abagyan, Ruben.

J Chem Inf Model ; 52(10): 2705-14, 2012 Oct 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22947092

16.

Successful Closure of Paravalvular Leak Using Computed Tomography Image Fusion and Planning With 3-Dimensional Printing.

Espinoza Rueda, Manuel A; Alcántara Meléndez, Marco A; González, Roberto Muratalla; Jiménez Valverde, Arnoldo S; García García, Juan F; Rivas Gálvez, Ronald E; Esparza, Tomas Hernández; Rodríguez, Gustavo; Sandoval Castillo, Luz D; Merino Rajme, José A.

JACC Case Rep ; 4(1): 36-41, 2022 Jan 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35036941

17.

SimiCon: a web tool for protein-ligand model comparison through calculation of equivalent atomic contacts.

Rueda, Manuel; Katritch, Vsevolod; Raush, Eugene; Abagyan, Ruben.

Bioinformatics ; 26(21): 2784-5, 2010 Nov 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-20871105

18.

Molecular Autopsy for Sudden Unexpected Death.

Torkamani, Ali; Muse, Evan D; Spencer, Emily G; Rueda, Manuel; Wagner, Glenn N; Lucas, Jonathan R; Topol, Eric J.

JAMA ; 316(14): 1492-1494, 2016 Oct 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27727376

19.

Ecosystem services show variable responses to future climate conditions in the Colombian páramos.

Diazgranados, Mauricio; Tovar, Carolina; Etherington, Thomas R; Rodríguez-Zorro, Paula A; Castellanos-Castro, Carolina; Galvis Rueda, Manuel; Flantua, Suzette G A.

PeerJ ; 9: e11370, 2021.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33987031

20.

Description of the Step-by-Step Technique With Snare Catheter for TAVR in Horizontal Aorta.

Espinoza Rueda, Manuel A; Muratalla González, Roberto; García García, Juan F; Morales Portano, Julieta D; Alcántara Meléndez, Marco A; Jiménez Valverde, Arnoldo S; Rivas Gálvez, Ronald E; Campos Delgadillo, Jorge L; González, César L; Gayosso Ortiz, José R; Merino Rajme, José A.

JACC Case Rep ; 3(17): 1811-1815, 2021 Dec 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34917960

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