rMATS: robust and flexible detection of differential alternative splicing from replicate RNA-Seq data.

Shen, Shihao; Park, Juw Won; Lu, Zhi-xiang; Lin, Lan; Henry, Michael D; Wu, Ying Nian; Zhou, Qing; Xing, Yi

Shen, Shihao; Park, Juw Won; Lu, Zhi-xiang; Lin, Lan; Henry, Michael D; Wu, Ying Nian; Zhou, Qing; Xing, Yi.

Afiliación

Shen S; Departments of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics and.
Park JW; Departments of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics and.
Lu ZX; Departments of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics and.
Lin L; Departments of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics and.
Henry MD; Departments of Molecular Physiology and Biophysics and Pathology, University of Iowa, Iowa City, IA 52242.
Wu YN; Statistics, University of California, Los Angeles, CA 90095; and.
Zhou Q; Statistics, University of California, Los Angeles, CA 90095; and.
Xing Y; Departments of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics and yxing@ucla.edu.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 111(51): E5593-601, 2014 Dec 23.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-25480548

Asunto(s)

Empalme Alternativo; Simulación por Computador; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; ARN/genética; Línea Celular Tumoral; Humanos; Masculino; Neoplasias de la Próstata/genética; Neoplasias de la Próstata/patología

Palabras clave

RNA sequencing; alternative splicing; exon; isoform; transcriptome

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Simulación por Computador / ARN / Empalme Alternativo / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Humans / Male Idioma: En Revista: Proc Natl Acad Sci U S A Año: 2014 Tipo del documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google