RNA virus attenuation by codon pair deoptimisation is an artefact of increases in CpG/UpA dinucleotide frequencies.

Tulloch, Fiona; Atkinson, Nicky J; Evans, David J; Ryan, Martin D; Simmonds, Peter

Tulloch, Fiona; Atkinson, Nicky J; Evans, David J; Ryan, Martin D; Simmonds, Peter.

Afiliación

Tulloch F; School of Biology, University of St Andrews, St Andrews, United Kingdom.
Atkinson NJ; Infection and Immunity Division, Roslin Institute, University of Edinburgh, Edinburgh, United Kingdom.
Evans DJ; School of Life Sciences, University of Warwick, Coventry, United Kingdom.
Ryan MD; School of Biology, University of St Andrews, St Andrews, United Kingdom.
Simmonds P; Infection and Immunity Division, Roslin Institute, University of Edinburgh, Edinburgh, United Kingdom.

Elife ; 3: e04531, 2014 Dec 09.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-25490153

Asunto(s)

Islas de CpG; Fosfatos de Dinucleósidos/metabolismo; Enterovirus Humano B/genética; ARN Viral/genética; Replicación Viral/genética; Emparejamiento Base; Línea Celular Tumoral; Codón; Fosfatos de Dinucleósidos/química; Enterovirus Humano B/metabolismo; Humanos; Células Musculares/metabolismo; Células Musculares/virología; Biosíntesis de Proteínas; ARN Viral/metabolismo; Vacunas Atenuadas; Vacunas Virales/biosíntesis; Vacunas Virales/química

Palabras clave

CpG; E. coli; arabidopsis; codon pair bias; dinucleotide; echovirus 7; evolutionary biology; genomics; human; infectious disease; microbiology; picornavirus; vaccine; viruses

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Replicación Viral / ARN Viral / Fosfatos de Dinucleósidos / Enterovirus Humano B / Islas de CpG Límite: Humans Idioma: En Revista: Elife Año: 2014 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido

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