A computational approach to distinguish somatic vs. germline origin of genomic alterations from deep sequencing of cancer specimens without a matched normal.

Sun, James X; He, Yuting; Sanford, Eric; Montesion, Meagan; Frampton, Garrett M; Vignot, Stéphane; Soria, Jean-Charles; Ross, Jeffrey S; Miller, Vincent A; Stephens, Phil J; Lipson, Doron; Yelensky, Roman

Sun, James X; He, Yuting; Sanford, Eric; Montesion, Meagan; Frampton, Garrett M; Vignot, Stéphane; Soria, Jean-Charles; Ross, Jeffrey S; Miller, Vincent A; Stephens, Phil J; Lipson, Doron; Yelensky, Roman.

Afiliación

Sun JX; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
He Y; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
Sanford E; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
Montesion M; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
Frampton GM; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
Vignot S; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) U981, Gustave Roussy, Villejuif Grand, Paris, France.
Soria JC; Oncology and Hematology Department, Hôpitaux de Chartres, Chartres, France.
Ross JS; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) U981, Gustave Roussy, Villejuif Grand, Paris, France.
Miller VA; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
Stephens PJ; Albany Medical College, Albany, NY, United States of America.
Lipson D; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.
Yelensky R; Foundation Medicine, Inc., Cambridge, MA, United States of America.

PLoS Comput Biol ; 14(2): e1005965, 2018 02.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29415044

Asunto(s)

Biología Computacional; Mutación de Línea Germinal; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Neoplasias/genética; Algoritmos; Alelos; Neoplasias de la Mama/genética; Carcinoma de Pulmón de Células no Pequeñas/genética; Neoplasias del Colon/genética; Simulación por Computador; Variaciones en el Número de Copia de ADN; Bases de Datos Genéticas; Exoma; Exones; Femenino; Frecuencia de los Genes; Genoma Humano; Genómica; Heterocigoto; Homocigoto; Humanos; Neoplasias Pulmonares/genética; Mutación; Ploidias; Polimorfismo de Nucleótido Simple; Probabilidad; Reproducibilidad de los Resultados; Análisis de Secuencia de ADN/métodos

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Mutación de Línea Germinal / Biología Computacional / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento / Neoplasias Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Female / Humans Idioma: En Revista: PLoS Comput Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google