ClermonTyping: an easy-to-use and accurate in silico method for Escherichia genus strain phylotyping.

Beghain, Johann; Bridier-Nahmias, Antoine; Le Nagard, Hervé; Denamur, Erick; Clermont, Olivier

Beghain, Johann; Bridier-Nahmias, Antoine; Le Nagard, Hervé; Denamur, Erick; Clermont, Olivier.

Afiliación

Beghain J; 1âIAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, F-75018 Paris, France.
Bridier-Nahmias A; 1âIAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, F-75018 Paris, France.
Le Nagard H; 1âIAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, F-75018 Paris, France.
Denamur E; 1âIAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, F-75018 Paris, France.
Clermont O; 2âAssistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Laboratoire de Génétique Moléculaire, F-75018 Paris, France.

Microb Genom ; 4(7)2018 07.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29916797

Asunto(s)

Infecciones por Enterobacteriaceae/microbiología; Escherichia/clasificación; Tipificación Molecular/métodos; Reacción en Cadena de la Polimerasa Multiplex/métodos; Secuencia de Bases; Simulación por Computador; Cartilla de ADN; Escherichia/genética; Transferencia de Gen Horizontal; Genoma Bacteriano; Mutación; Filogenia; Polimorfismo de Nucleótido Simple; Secuenciación Completa del Genoma

Palabras clave

E. coli; Escherichia; epidemiology; phylogeny; tool; typing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Infecciones por Enterobacteriaceae / Escherichia / Tipificación Molecular / Reacción en Cadena de la Polimerasa Multiplex Idioma: En Revista: Microb Genom Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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