A neural network based model effectively predicts enhancers from clinical ATAC-seq samples.

Thibodeau, Asa; Uyar, Asli; Khetan, Shubham; Stitzel, Michael L; Ucar, Duygu

Thibodeau, Asa; Uyar, Asli; Khetan, Shubham; Stitzel, Michael L; Ucar, Duygu.

Afiliación

Thibodeau A; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, 06032, USA.
Uyar A; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, 06032, USA.
Khetan S; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, 06032, USA.
Stitzel ML; Department of Genetics and Genome Sciences, University of Connecticut Health Center, Farmington, CT, 06030, USA.
Ucar D; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, 06032, USA.

Sci Rep ; 8(1): 16048, 2018 10 30.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30375457

Asunto(s)

Sitios de Unión; Elementos de Facilitación Genéticos; Redes Neurales de la Computación; Transposasas/metabolismo; Línea Celular; Biología Computacional/métodos; Perfilación de la Expresión Génica; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Curva ROC; Sensibilidad y Especificidad; Análisis de Secuencia de ADN; Transcriptoma; Transposasas/química

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Sitios de Unión / Elementos de Facilitación Genéticos / Redes Neurales de la Computación / Transposasas Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Sci Rep Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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