Alevin efficiently estimates accurate gene abundances from dscRNA-seq data.

Srivastava, Avi; Malik, Laraib; Smith, Tom; Sudbery, Ian; Patro, Rob

Srivastava, Avi; Malik, Laraib; Smith, Tom; Sudbery, Ian; Patro, Rob.

Afiliación

Srivastava A; Department of Computer Science, Stony Brook University, Stony Brook, USA.
Malik L; Department of Computer Science, Stony Brook University, Stony Brook, USA.
Smith T; Cambridge Centre for Proteomics, Department of Biochemistry, University of Cambridge, Cambridge, CB2 1GA, UK.
Sudbery I; Sheffield Institute for Nucleic Acids, Department of Molecular Biology and Biotechnology, The University of Sheffield, Sheffield, S10 2TN, UK.
Patro R; Department of Computer Science, Stony Brook University, Stony Brook, USA. rob.patro@cs.stonybrook.edu.

Genome Biol ; 20(1): 65, 2019 03 27.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30917859

Asunto(s)

Análisis de Secuencia de ARN; Análisis de la Célula Individual; Programas Informáticos; Animales; Código de Barras del ADN Taxonómico; Humanos; Ratones

Palabras clave

Cellular barcode; Quantification; Single-cell RNA-seq; UMI deduplication

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Análisis de Secuencia de ARN / Análisis de la Célula Individual Tipo de estudio: Evaluation_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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