HOME: a histogram based machine learning approach for effective identification of differentially methylated regions.

Srivastava, Akanksha; Karpievitch, Yuliya V; Eichten, Steven R; Borevitz, Justin O; Lister, Ryan

Srivastava, Akanksha; Karpievitch, Yuliya V; Eichten, Steven R; Borevitz, Justin O; Lister, Ryan.

Afiliación

Srivastava A; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The University of Western Australia, Perth, Australia.
Karpievitch YV; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The University of Western Australia, Perth, Australia.
Eichten SR; Harry Perkins Institute of Medical Research, Perth, Australia.
Borevitz JO; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The Australian National University, Canberra, Australia.
Lister R; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The Australian National University, Canberra, Australia.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 253, 2019 May 16.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31096906

Asunto(s)

Algoritmos; Metilación de ADN/genética; Aprendizaje Automático; Animales; Simulación por Computador; Bases de Datos Genéticas; Ratones; Anotación de Secuencia Molecular; Factores de Tiempo

Palabras clave

DMR identification; DNA methylation; Epigenetics; SVM; Whole genome bisulfite sequencing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / Metilación de ADN / Aprendizaje Automático Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Australia

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