CAGEfightR: analysis of 5'-end data using R/Bioconductor.

Thodberg, Malte; Thieffry, Axel; Vitting-Seerup, Kristoffer; Andersson, Robin; Sandelin, Albin

Thodberg, Malte; Thieffry, Axel; Vitting-Seerup, Kristoffer; Andersson, Robin; Sandelin, Albin.

Afiliación

Thodberg M; Department of Biology, University of Copenhagen, Ole Maaløes Vej 5, DK2100, Copenhagen N, Denmark. malte.thodberg@bric.ku.dk.
Thieffry A; Biotech Research and Innovation Centre, University of Copenhagen, Ole Maaløes Vej 5, DK2100, Copenhagen N, Denmark. malte.thodberg@bric.ku.dk.
Vitting-Seerup K; Department of Biology, University of Copenhagen, Ole Maaløes Vej 5, DK2100, Copenhagen N, Denmark.
Andersson R; Biotech Research and Innovation Centre, University of Copenhagen, Ole Maaløes Vej 5, DK2100, Copenhagen N, Denmark.
Sandelin A; Department of Biology, University of Copenhagen, Ole Maaløes Vej 5, DK2100, Copenhagen N, Denmark.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 487, 2019 Oct 04.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31585526

Asunto(s)

Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Programas Informáticos; Sitio de Iniciación de la Transcripción

Palabras clave

5'-end methods; Bioconductor; CAGE; Enhancer; Enhancer RNA; Promoter; R-package; Transcription start site

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Perfilación de la Expresión Génica / Sitio de Iniciación de la Transcripción Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Dinamarca

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