In silico prediction of host-pathogen protein interactions in melioidosis pathogen Burkholderia pseudomallei and human reveals novel virulence factors and their targets.

Loaiza, Cristian D; Duhan, Naveen; Lister, Matthew; Kaundal, Rakesh

Loaiza, Cristian D; Duhan, Naveen; Lister, Matthew; Kaundal, Rakesh.

Afiliación

Loaiza CD; Center for Integrated BioSystems/Department of Plants, Soils, and Climate, College of Agriculture and Applied Sciences, Utah State University, USA.
Duhan N; Center for Integrated BioSystems/Department of Plants, Soils, and Climate, College of Agriculture and Applied Sciences, Utah State University, USA.
Lister M; Bioinformatics Facility, Center for Integrated BioSystems, Utah State University, USA.
Kaundal R; Department of Plants, Soils, and Climate/Center for Integrated BioSystems, College of Agriculture and Applied Sciences, Utah State University, Logan, UT 84322 USA.

Brief Bioinform ; 22(3)2021 05 20.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32444871

Asunto(s)

Proteínas Bacterianas/metabolismo; Burkholderia pseudomallei/metabolismo; Simulación por Computador; Melioidosis/metabolismo; Factores de Virulencia/metabolismo; Proteínas Bacterianas/antagonistas & inhibidores; Proteínas Bacterianas/genética; Burkholderia pseudomallei/genética; Burkholderia pseudomallei/patogenicidad; Biología Computacional/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Ontología de Genes; Interacciones Huésped-Patógeno/efectos de los fármacos; Interacciones Huésped-Patógeno/genética; Humanos; Melioidosis/tratamiento farmacológico; Melioidosis/genética; Melioidosis/microbiología; Terapia Molecular Dirigida/métodos; Preparaciones Farmacéuticas/administración & dosificación; Unión Proteica/efectos de los fármacos; Mapas de Interacción de Proteínas/efectos de los fármacos; Mapas de Interacción de Proteínas/genética; Virulencia/genética; Factores de Virulencia/antagonistas & inhibidores; Factores de Virulencia/genética

Palabras clave

Burkholderia pseudomallei; Homo sapiens; domaindomain interactions; hostpathogen interactions; interolog; melioidosis; networks; visualization

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas Bacterianas / Simulación por Computador / Burkholderia pseudomallei / Factores de Virulencia / Melioidosis Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Brief Bioinform Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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