Detecting sample swaps in diverse NGS data types using linkage disequilibrium.

Javed, Nauman; Farjoun, Yossi; Fennell, Tim J; Epstein, Charles B; Bernstein, Bradley E; Shoresh, Noam

Javed, Nauman; Farjoun, Yossi; Fennell, Tim J; Epstein, Charles B; Bernstein, Bradley E; Shoresh, Noam.

Afiliación

Javed N; Department of Pathology and Center for Cancer Research, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, 02114, USA.
Farjoun Y; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.
Fennell TJ; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.
Epstein CB; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.
Bernstein BE; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.
Shoresh N; Department of Pathology and Center for Cancer Research, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, 02114, USA.

Nat Commun ; 11(1): 3697, 2020 07 29.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32728101

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Desequilibrio de Ligamiento/genética; Bases de Datos de Ácidos Nucleicos; Genotipo; Células HEK293; Células Endoteliales de la Vena Umbilical Humana/metabolismo; Humanos; Células K562; Escala de Lod; Anotación de Secuencia Molecular

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Desequilibrio de Ligamiento / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Nat Commun Asunto de la revista: BIOLOGIA / CIENCIA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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