Selecting single cell clustering parameter values using subsampling-based robustness metrics.

Patterson-Cross, Ryan B; Levine, Ariel J; Menon, Vilas

Patterson-Cross, Ryan B; Levine, Ariel J; Menon, Vilas.

Afiliación

Patterson-Cross RB; Spinal Circuits and Plasticity Unit, National Institute of Neurological Disorders and Stroke, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA.
Levine AJ; Spinal Circuits and Plasticity Unit, National Institute of Neurological Disorders and Stroke, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA. ariel.levine@nih.gov.
Menon V; Department of Neurology, Center for Translational and Computational Neuroimmunology, Columbia University, New York City, NY, USA. vm2545@cumc.columbia.edu.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 39, 2021 Feb 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33522897

Asunto(s)

Benchmarking; Análisis de Datos; Leucocitos Mononucleares; Algoritmos; Análisis por Conglomerados; Perfilación de la Expresión Génica

Palabras clave

Clustering; Parameter selection; Resolution; Single cell RNAseq

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Leucocitos Mononucleares / Benchmarking / Análisis de Datos Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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