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Shotgun metagenomic sequencing of the first case of monkeypox virus in Brazil, 2022.
Claro, Ingra Morales; Romano, Camila Malta; Candido, Darlan da Silva; Lima, Evelyn Lepka de; Lindoso, José Angelo Lauletta; Ramundo, Mariana Severo; Moreira, Filipe Romero Rebello; Barra, Luiz Alberto Costa; Borges, Luciana Marques Sansão; Medeiros, Lucas Alberto; Tomishige, Marcia Y S; Moutinho, Tomas; Silva, Anderson José Dias da; Rodrigues, Camila Cristina Martini; Azevedo, Luiz Cesar Fernandes de; Villas-Boas, Lucy Santos; Silva, Camila Alves Maia da; Coletti, Thaís Moura; Manuli, Erika R; O'Toole, Aine; Quick, Joshua; Loman, Nicholas; Rambaut, Andrew; Faria, Nuno R; Figueiredo-Mello, Claudia; Sabino, Ester Cerdeira.
Afiliación
  • Claro IM; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Romano CM; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom.
  • Candido DDS; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Lima EL; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Lindoso JAL; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom.
  • Ramundo MS; University of Oxford, Department of Zoology, Oxford, United Kingdom.
  • Moreira FRR; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Barra LAC; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Borges LMS; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Medeiros LA; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Tomishige MYS; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Moutinho T; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom.
  • Silva AJDD; Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Biologia, Departamento de Genética, Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
  • Rodrigues CCM; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Azevedo LCF; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Villas-Boas LS; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Silva CAMD; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Coletti TM; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Manuli ER; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • O'Toole A; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Quick J; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Loman N; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Rambaut A; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Faria NR; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Figueiredo-Mello C; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Sabino EC; University of Edinburgh, Institute of Ecology and Evolution, Edinburgh, United Kingdom.
Rev Inst Med Trop Sao Paulo ; 64: e48, 2022.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35749419
ABSTRACT
Monkeypox virus (MPXV), a zoonotic virus endemic to the African continent, has been reported in 33 non-endemic countries since May 2022. We report an almost complete genome of the first confirmed case of MPXV in Brazil. Shotgun metagenomic sequencing was completed in 18 hours, from DNA extraction to consensus sequence generation.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Monkeypox virus / Mpox Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Humans País/Región como asunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Rev Inst Med Trop Sao Paulo Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil
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