Reliability of species detection in 16S microbiome analysis: Comparison of five widely used pipelines and recommendations for a more standardized approach.

Hiergeist, Andreas; Ruelle, Jean; Emler, Stefan; Gessner, André

Hiergeist, Andreas; Ruelle, Jean; Emler, Stefan; Gessner, André.

Afiliación

Hiergeist A; Institute of Clinical Microbiology and Hygiene, University Hospital Regensburg, Regensburg, Germany.
Ruelle J; SmartGene Services SARL, Lausanne, Switzerland.
Emler S; SmartGene Services SARL, Lausanne, Switzerland.
Gessner A; Institute of Clinical Microbiology and Hygiene, University Hospital Regensburg, Regensburg, Germany.

PLoS One ; 18(2): e0280870, 2023.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-36795699

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Microbiota; Reproducibilidad de los Resultados; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Microbiota/genética; Bacterias/genética; Secuencia de Bases; ARN Ribosómico 16S/genética; Análisis de Secuencia de ADN/métodos

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento / Microbiota Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Guideline Idioma: En Revista: PLoS One Asunto de la revista: CIENCIA / MEDICINA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

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