Ornaments for efficient allele-specific expression estimation with bias correction.

Adduri, Abhinav; Kim, Seyoung

Adduri, Abhinav; Kim, Seyoung.

Afiliación

Adduri A; Computational Biology Department, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA 15213, USA.
Kim S; Department of Epidemiology, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA 15261, USA. Electronic address: sssykim@acm.org.

Am J Hum Genet ; 111(8): 1770-1781, 2024 Aug 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-39047729

Asunto(s)

Alelos; Humanos; Transcriptoma/genética; Impresión Genómica; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Programas Informáticos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos

Palabras clave

RNA-seq; SNPs; allele-specific expression; bias correction; de Bruijn graph; genetic variants; indels; mixture model; transcriptome quantification

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Alelos Límite: Humans Idioma: En Revista: Am J Hum Genet Año: 2024 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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