Comparative analysis of RNA-Seq alignment algorithms and the RNA-Seq unified mapper (RUM).

Grant, Gregory R; Farkas, Michael H; Pizarro, Angel D; Lahens, Nicholas F; Schug, Jonathan; Brunk, Brian P; Stoeckert, Christian J; Hogenesch, John B; Pierce, Eric A

Grant, Gregory R; Farkas, Michael H; Pizarro, Angel D; Lahens, Nicholas F; Schug, Jonathan; Brunk, Brian P; Stoeckert, Christian J; Hogenesch, John B; Pierce, Eric A.

Afiliação

Grant GR; Penn Center for Bioinformatics, University of Pennsylvania School of Medicine, Philadelphia, PA 19104, USA. ggrant@pcbi.upenn.edu

Bioinformatics ; 27(18): 2518-28, 2011 Sep 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-21775302

Assuntos

Análise de Sequência de RNA/métodos; Algoritmos; Animais; Sequência de Bases; Benchmarking; Análise por Conglomerados; Éxons; Biblioteca Gênica; Genoma; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Camundongos; Modelos Genéticos; Dados de Sequência Molecular; RNA/genética; Splicing de RNA; Alinhamento de Sequência; Software

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA Limite: Animals Idioma: En Revista: Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2011 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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