A highly efficient and effective motif discovery method for ChIP-seq/ChIP-chip data using positional information.

Ma, Xiaotu; Kulkarni, Ashwinikumar; Zhang, Zhihua; Xuan, Zhenyu; Serfling, Robert; Zhang, Michael Q

Ma, Xiaotu; Kulkarni, Ashwinikumar; Zhang, Zhihua; Xuan, Zhenyu; Serfling, Robert; Zhang, Michael Q.

Afiliação

Ma X; Department of Molecular and Cell Biology, Center for Systems Biology, University of Texas at Dallas, 800 W. Campbell Road, Richardson, TX 75080, USA.

Nucleic Acids Res ; 40(7): e50, 2012 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-22228832

Assuntos

Imunoprecipitação da Cromatina; Elementos Reguladores de Transcrição; Software; Fatores de Transcrição/metabolismo; Algoritmos; Animais; Sítios de Ligação; Fator de Ligação a CCCTC; Análise por Conglomerados; Simulação por Computador; Drosophila melanogaster/genética; Células-Tronco Embrionárias/metabolismo; Redes Reguladoras de Genes; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Camundongos; Motivos de Nucleotídeos; Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos; Proteínas Repressoras; Análise de Sequência de DNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Software / Imunoprecipitação da Cromatina / Elementos Reguladores de Transcrição Tipo de estudo: Evaluation_studies / Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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