A computational approach to enzyme design: predicting &#969;-aminotransferase catalytic activity using docking and MM-GBSA scoring.

Sirin, Sarah; Kumar, Rajesh; Martinez, Carlos; Karmilowicz, Michael J; Ghosh, Preeyantee; Abramov, Yuriy A; Martin, Van; Sherman, Woody

A computational approach to enzyme design: predicting ω-aminotransferase catalytic activity using docking and MM-GBSA scoring.

Sirin, Sarah; Kumar, Rajesh; Martinez, Carlos; Karmilowicz, Michael J; Ghosh, Preeyantee; Abramov, Yuriy A; Martin, Van; Sherman, Woody.

Afiliação

Sirin S; Schrödinger, Inc. , 120 West 45th Street, 29th Floor, New York, New York 10036, United States.

J Chem Inf Model ; 54(8): 2334-46, 2014 Aug 25.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25005922

Assuntos

Alanina Transaminase/química; Alanina/química; Caprilatos/química; Simulação de Dinâmica Molecular; Engenharia de Proteínas/métodos; Ácido Pirúvico/química; Alanina Transaminase/genética; Biocatálise; Domínio Catalítico; Cristalografia por Raios X; Humanos; Mutação; Ligação Proteica; Estrutura Secundária de Proteína; Estrutura Terciária de Proteína; Relação Estrutura-Atividade; Especificidade por Substrato; Termodinâmica

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Caprilatos / Engenharia de Proteínas / Ácido Pirúvico / Alanina / Alanina Transaminase / Simulação de Dinâmica Molecular Tipo de estudo: Guideline / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: J Chem Inf Model Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA / QUIMICA Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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