Identification of protein-interacting nucleotides in a RNA sequence using composition profile of tri-nucleotides.

Panwar, Bharat; Raghava, Gajendra P S

Panwar, Bharat; Raghava, Gajendra P S.

Afiliação

Panwar B; Bioinformatics Centre, CSIR-Institute of Microbial Technology, Sector 39A, Chandigarh, India. Electronic address: bharat@imtech.res.in.
Raghava GP; Bioinformatics Centre, CSIR-Institute of Microbial Technology, Sector 39A, Chandigarh, India. Electronic address: http://www.imtech.res.in/raghava/

Genomics ; 105(4): 197-203, 2015 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25640448

Assuntos

Proteínas de Ligação a RNA/química; RNA/química; Análise de Sequência de RNA/métodos; Software; Sequência de Bases; Sítios de Ligação; Modelos Moleculares; RNA/metabolismo; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Máquina de Vetores de Suporte

Palavras-chave

Binary profile of patterns (BPP); Prediction; Protein-interacting nucleotide (PIN); RNApin; SVM; Tri-nucleotide composition profile of patterns (TNCPP)

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / RNA / Proteínas de Ligação a RNA / Análise de Sequência de RNA Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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