CRISPR knockout screening outperforms shRNA and CRISPRi in identifying essential genes.
Nat Biotechnol
; 34(6): 631-3, 2016 Jun.
Article
em En
| MEDLINE
| ID: mdl-27111720
ABSTRACT
High-throughput genetic screens have become essential tools for studying a wide variety of biological processes. Here we experimentally compare systems based on clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/CRISPR-associated protein 9 (Cas9) or its transcriptionally repressive variant, CRISPR-interference (CRISPRi), with a traditional short hairpin RNA (shRNA)-based system for performing lethality screens. We find that the CRISPR technology performed best, with low noise, minimal off-target effects and consistent activity across reagents.
Texto completo:
1
Coleções:
01-internacional
Base de dados:
MEDLINE
Assunto principal:
Marcadores Genéticos
/
Testes Genéticos
/
Perfilação da Expressão Gênica
/
RNA Interferente Pequeno
/
Técnicas de Inativação de Genes
/
Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas
Tipo de estudo:
Diagnostic_studies
/
Evaluation_studies
/
Screening_studies
Idioma:
En
Revista:
Nat Biotechnol
Assunto da revista:
BIOTECNOLOGIA
Ano de publicação:
2016
Tipo de documento:
Article
País de afiliação:
Holanda