Homology to peptide pattern for annotation of carbohydrate-active enzymes and prediction of function.

Busk, P K; Pilgaard, B; Lezyk, M J; Meyer, A S; Lange, L

Busk, P K; Pilgaard, B; Lezyk, M J; Meyer, A S; Lange, L.

Afiliação

Busk PK; Department of Chemical and Biochemical Engineering, Technical University of Denmark, Søltofts Plads, Building 229, 2800, Kgs. Lyngby, Denmark. pbus@kt.dtu.dk.
Pilgaard B; Department of Chemical and Biochemical Engineering, Technical University of Denmark, Søltofts Plads, Building 229, 2800, Kgs. Lyngby, Denmark.
Lezyk MJ; Department of Chemical and Biochemical Engineering, Technical University of Denmark, Søltofts Plads, Building 229, 2800, Kgs. Lyngby, Denmark.
Meyer AS; Department of Chemical and Biochemical Engineering, Technical University of Denmark, Søltofts Plads, Building 229, 2800, Kgs. Lyngby, Denmark.
Lange L; Department of Chemical and Biochemical Engineering, Technical University of Denmark, Søltofts Plads, Building 229, 2800, Kgs. Lyngby, Denmark.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 214, 2017 Apr 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28403817

Assuntos

Bactérias/enzimologia; Metabolismo dos Carboidratos; Fungos/classificação; Fungos/enzimologia; Glicosídeo Hidrolases/genética; Oxigenases de Função Mista/genética; Bactérias/classificação; Bactérias/genética; Bactérias/metabolismo; Bases de Dados de Proteínas; Microbiologia Ambiental; Fungos/genética; Fungos/metabolismo; Genoma Bacteriano; Genoma Fúngico; Glicosídeo Hidrolases/química; Oxigenases de Função Mista/química; Anotação de Sequência Molecular

Palavras-chave

Annotation; Carbohydrate-active enzymes; Genomics; Software

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Metabolismo dos Carboidratos / Fungos / Glicosídeo Hidrolases / Oxigenases de Função Mista Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Dinamarca

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