A streamlined method for analysing genome-wide DNA methylation patterns from low amounts of FFPE DNA.

Ludgate, Jackie L; Wright, James; Stockwell, Peter A; Morison, Ian M; Eccles, Michael R; Chatterjee, Aniruddha

Ludgate, Jackie L; Wright, James; Stockwell, Peter A; Morison, Ian M; Eccles, Michael R; Chatterjee, Aniruddha.

Afiliação

Ludgate JL; Department of Pathology, Dunedin School of Medicine, University of Otago, 270 Great King Street, P.O. Box 56, Dunedin, 9054, New Zealand.
Wright J; Department of Pathology, Dunedin School of Medicine, University of Otago, 270 Great King Street, P.O. Box 56, Dunedin, 9054, New Zealand.
Stockwell PA; School of Biosciences, Cardiff University, Sir Martin Evans Building, Museum Avenue, Cardiff, CF10 3AX, UK.
Morison IM; Department of Biochemistry, University of Otago, 710 Cumberland Street, Dunedin, 9054, New Zealand.
Eccles MR; Department of Pathology, Dunedin School of Medicine, University of Otago, 270 Great King Street, P.O. Box 56, Dunedin, 9054, New Zealand.
Chatterjee A; Department of Pathology, Dunedin School of Medicine, University of Otago, 270 Great King Street, P.O. Box 56, Dunedin, 9054, New Zealand.

BMC Med Genomics ; 10(1): 54, 2017 08 31.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28859641

Assuntos

Metilação de DNA; DNA/genética; Formaldeído; Genômica/métodos; Inclusão em Parafina; Fixação de Tecidos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

Bisulfite sequencing; DNA extraction; DNA methylation; FFPE tissue; Genome-wide; RRBS

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: DNA / Fixação de Tecidos / Inclusão em Parafina / Metilação de DNA / Genômica / Formaldeído Tipo de estudo: Guideline Idioma: En Revista: BMC Med Genomics Assunto da revista: GENETICA MEDICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Nova Zelândia

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