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HLAProfiler utilizes k-mer profiles to improve HLA calling accuracy for rare and common alleles in RNA-seq data.
Buchkovich, Martin L; Brown, Chad C; Robasky, Kimberly; Chai, Shengjie; Westfall, Sharon; Vincent, Benjamin G; Weimer, Eric T; Powers, Jason G.
Afiliação
  • Buchkovich ML; Translational Genomics Department, Q2 Solutions | EA Genomics, a Quintiles Quest Joint Venture, Morrisville, NC, 27560, USA. martin.buchkovich@q2labsolutions.com.
  • Brown CC; Translational Genomics Department, Q2 Solutions | EA Genomics, a Quintiles Quest Joint Venture, Morrisville, NC, 27560, USA.
  • Robasky K; Translational Genomics Department, Q2 Solutions | EA Genomics, a Quintiles Quest Joint Venture, Morrisville, NC, 27560, USA.
  • Chai S; Lineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC, 27599, USA.
  • Westfall S; Curriculum in Bioinformatics and Computational Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC, 27599, USA.
  • Vincent BG; Translational Genomics Department, Q2 Solutions | EA Genomics, a Quintiles Quest Joint Venture, Morrisville, NC, 27560, USA.
  • Weimer ET; Lineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC, 27599, USA.
  • Powers JG; Curriculum in Bioinformatics and Computational Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC, 27599, USA.
Genome Med ; 9(1): 86, 2017 09 27.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28954626
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Teste de Histocompatibilidade / Análise de Sequência de RNA / Antígenos HLA Tipo de estudo: Evaluation_studies / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Genome Med Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos
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