MethSurv: a web tool to perform multivariable survival analysis using DNA methylation data.

Modhukur, Vijayachitra; Iljasenko, Tatjana; Metsalu, Tauno; Lokk, Kaie; Laisk-Podar, Triin; Vilo, Jaak

Modhukur, Vijayachitra; Iljasenko, Tatjana; Metsalu, Tauno; Lokk, Kaie; Laisk-Podar, Triin; Vilo, Jaak.

Afiliação

Modhukur V; Institute of Computer Science, University of Tartu, 50409 Tartu, Estonia.
Iljasenko T; Institute of Computer Science, University of Tartu, 50409 Tartu, Estonia.
Metsalu T; Institute of Computer Science, University of Tartu, 50409 Tartu, Estonia.
Lokk K; United Laboratories of Tartu University Hospital, Tartu University Hospital, 50406 Tartu, Estonia.
Laisk-Podar T; Competence Centre on Health Technologies, 50410 Tartu, Estonia.
Vilo J; Women's Clinic, Institute of Clinical Medicine, University of Tartu, 50406 Tartu, Estonia.

Epigenomics ; 10(3): 277-288, 2018 03.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29264942

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Metilação de DNA; DNA de Neoplasias/genética; Epigênese Genética; Neoplasias/genética; Software; Atlas como Assunto; Análise por Conglomerados; Ilhas de CpG; DNA de Neoplasias/metabolismo; Mineração de Dados; Genoma Humano; Humanos; Estimativa de Kaplan-Meier; Anotação de Sequência Molecular; Neoplasias/diagnóstico; Neoplasias/metabolismo; Neoplasias/mortalidade; Modelos de Riscos Proporcionais

Palavras-chave

Cox Proportional-Hazards; DNA methylation; Illumina 450 K; KaplanMeier; TCGA; biomarkers; cancer survival analysis; clustering; epigenetics; prognosis

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / DNA de Neoplasias / Biologia Computacional / Metilação de DNA / Epigênese Genética / Neoplasias Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Epigenomics Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estônia

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