Limitations of alignment-free tools in total RNA-seq quantification.

Wu, Douglas C; Yao, Jun; Ho, Kevin S; Lambowitz, Alan M; Wilke, Claus O

Wu, Douglas C; Yao, Jun; Ho, Kevin S; Lambowitz, Alan M; Wilke, Claus O.

Afiliação

Wu DC; Institute for Cellular and Molecular Biology, The University of Texas at Austin, Austin, 78712, TX, USA.
Yao J; Department of Molecular Biosciences, The University of Texas at Austin, Austin, 78712, TX, USA.
Ho KS; Institute for Cellular and Molecular Biology, The University of Texas at Austin, Austin, 78712, TX, USA.
Lambowitz AM; Department of Molecular Biosciences, The University of Texas at Austin, Austin, 78712, TX, USA.
Wilke CO; Institute for Cellular and Molecular Biology, The University of Texas at Austin, Austin, 78712, TX, USA.

BMC Genomics ; 19(1): 510, 2018 Jul 03.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29969991

Assuntos

RNA/química; Análise de Sequência de RNA/métodos; Algoritmos; Área Sob a Curva; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; RNA/metabolismo; RNA Ribossômico/química; RNA Ribossômico/metabolismo; RNA de Transferência/química; RNA de Transferência/metabolismo; Curva ROC

Palavras-chave

RNA-seq; TGIRT-seq; k-mer

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA / Análise de Sequência de RNA Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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