ParStream-seq: An improved method of handling next generation sequence data.

Mondal, Sudip; Maji, Ranjan Kumar; Ghosh, Zhumur; Khatua, Sunirmal

Mondal, Sudip; Maji, Ranjan Kumar; Ghosh, Zhumur; Khatua, Sunirmal.

Afiliação

Mondal S; Department of Computer Science and Engineering, University of Calcutta, Kolkata, India.
Maji RK; Bioinformatics Center, Bose Institute, Kolkata, India.
Ghosh Z; Bioinformatics Center, Bose Institute, Kolkata, India.
Khatua S; Department of Computer Science and Engineering, University of Calcutta, Kolkata, India. Electronic address: skhatuacomp@caluniv.ac.in.

Genomics ; 111(6): 1641-1650, 2019 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30448525

Assuntos

Algoritmos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Alinhamento de Sequência; Análise de Sequência de DNA; Software

Palavras-chave

Alignment; Biological big data; HDFS; NGS; Parallel computing; Streaming

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Software / Alinhamento de Sequência / Análise de Sequência de DNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Idioma: En Revista: Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Índia

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