Mind the gaps: overlooking inaccessible regions confounds statistical testing in genome analysis.

Domanska, Diana; Kanduri, Chakravarthi; Simovski, Boris; Sandve, Geir Kjetil

Domanska, Diana; Kanduri, Chakravarthi; Simovski, Boris; Sandve, Geir Kjetil.

Afiliação

Domanska D; Department of Informatics, University of Oslo, Oslo, Norway. dianadom@ifi.uio.no.
Kanduri C; Department of Informatics, University of Oslo, Oslo, Norway.
Simovski B; K. G. Jebsen Coeliac Disease Research Centre, Oslo, Norway.
Sandve GK; Department of Informatics, University of Oslo, Oslo, Norway.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 481, 2018 Dec 14.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30547739

Assuntos

Fatores de Confusão Epidemiológicos; Genoma Humano; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Estatística como Assunto; Genômica; Humanos

Palavras-chave

Assembly gaps; BED format; Co-occurrence analysis; Colocalization analysis; Genomic overlap analysis; Reference genome; Region set enrichment analysis; Statistical genome analysis

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Humano / Fatores de Confusão Epidemiológicos / Estatística como Assunto / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Noruega

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