Predicting binding poses and affinity ranking in D3R Grand Challenge using PL-PatchSurfer2.0.

Shin, Woong-Hee; Kihara, Daisuke

Shin, Woong-Hee; Kihara, Daisuke.

Afiliação

Shin WH; Department of Biological Science, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA.
Kihara D; Department of Chemistry Education, Sunchon National University, Suncheon, 57922, Republic of Korea.

J Comput Aided Mol Des ; 33(12): 1083-1094, 2019 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31506789

Assuntos

Secretases da Proteína Precursora do Amiloide/química; Ácido Aspártico Endopeptidases/química; Peptídeos e Proteínas de Sinalização Intracelular/química; Simulação de Acoplamento Molecular; Proteínas Nucleares/química; Ligação Proteica/genética; Secretases da Proteína Precursora do Amiloide/genética; Ácido Aspártico Endopeptidases/genética; Sítios de Ligação/genética; Desenho Assistido por Computador; Cristalografia por Raios X; Desenho de Fármacos; Descoberta de Drogas; Peptídeos e Proteínas de Sinalização Intracelular/genética; Ligantes; Proteínas Nucleares/genética; Conformação Proteica; Proteínas/química; Proteínas/genética; Relação Estrutura-Atividade; Termodinâmica

Palavras-chave

BACE-1; CatS; D3R Grand Challenge; PL-PatchSurfer; Proteinligand interaction; Virtual screening

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Ligação Proteica / Proteínas Nucleares / Ácido Aspártico Endopeptidases / Peptídeos e Proteínas de Sinalização Intracelular / Secretases da Proteína Precursora do Amiloide / Simulação de Acoplamento Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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