Prevalence and Implications of Contamination in Public Genomic Resources: A Case Study of 43 Reference Arthropod Assemblies.

Francois, Clementine M; Durand, Faustine; Figuet, Emeric; Galtier, Nicolas

Francois, Clementine M; Durand, Faustine; Figuet, Emeric; Galtier, Nicolas.

Afiliação

Francois CM; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France clementine.francois@univ-lyon1.fr.
Durand F; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France.
Figuet E; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France.
Galtier N; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France.

G3 (Bethesda) ; 10(2): 721-730, 2020 02 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31862787

Assuntos

Artrópodes/genética; Contaminação por DNA; Genoma; Genômica; Animais; Biologia Computacional/métodos; Bases de Dados Genéticas; Genoma de Inseto; Genômica/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Anotação de Sequência Molecular; Filogenia; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

automated detection pipeline; contaminant sequences; curation of genomic databases; horizontal gene transfer

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Artrópodes / Genoma / Genômica / Contaminação por DNA Tipo de estudo: Prevalence_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: G3 (Bethesda) Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google