Exhaustive search of the configurational space of heat-shock protein 90 with its inhibitor by multicanonical molecular dynamics based dynamic docking.

Bekker, Gert-Jan; Araki, Mitsugu; Oshima, Kanji; Okuno, Yasushi; Kamiya, Narutoshi

Bekker, Gert-Jan; Araki, Mitsugu; Oshima, Kanji; Okuno, Yasushi; Kamiya, Narutoshi.

Afiliação

Bekker GJ; Institute for Protein Research, Osaka University, Osaka, Japan.
Araki M; Graduate School of Medicine, Kyoto University, Kyoto, Japan.
Oshima K; Biotechnology Research Laboratories, Kaneka Corporation, Takasago, Hyogo, Japan.
Okuno Y; Graduate School of Medicine, Kyoto University, Kyoto, Japan.
Kamiya N; Graduate School of Simulation Studies, University of Hyogo, Kobe, Hyogo, Japan.

J Comput Chem ; 41(17): 1606-1615, 2020 06 30.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32267975

Assuntos

Proteínas de Choque Térmico HSP90/química; Simulação de Acoplamento Molecular; Simulação de Dinâmica Molecular; Algoritmos; Proteínas de Choque Térmico HSP90/antagonistas & inibidores; Proteínas de Choque Térmico HSP90/metabolismo; Ligantes

Palavras-chave

dynamic docking; enhanced conformational sampling; free energy landscape; heat-shock protein 90; multicanonical Molecular Dynamics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas de Choque Térmico HSP90 / Simulação de Dinâmica Molecular / Simulação de Acoplamento Molecular Idioma: En Revista: J Comput Chem Assunto da revista: QUIMICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Japão

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