Model-based analysis of sample index hopping reveals its widespread artifacts in multiplexed single-cell RNA-sequencing.

Farouni, Rick; Djambazian, Haig; Ferri, Lorenzo E; Ragoussis, Jiannis; Najafabadi, Hamed S

Farouni, Rick; Djambazian, Haig; Ferri, Lorenzo E; Ragoussis, Jiannis; Najafabadi, Hamed S.

Afiliação

Farouni R; Department of Human Genetics, McGill University, Montreal, QC, H3A 0C7, Canada. tarek.farouni@mcgill.ca.
Djambazian H; McGill University Genome Centre, Montreal, QC, H3A 0G1, Canada. tarek.farouni@mcgill.ca.
Ferri LE; Department of Human Genetics, McGill University, Montreal, QC, H3A 0C7, Canada.
Ragoussis J; McGill University Genome Centre, Montreal, QC, H3A 0G1, Canada.
Najafabadi HS; Department of Surgery, McGill University, Montreal, QC, H3G 1A4, Canada.

Nat Commun ; 11(1): 2704, 2020 06 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32483174

Assuntos

Algoritmos; Artefatos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Modelos Estatísticos; RNA/análise; Análise de Célula Única/métodos; Simulação por Computador; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/normas; Humanos; RNA/genética; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Célula Única/normas

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / RNA / Modelos Estatísticos / Artefatos / Análise de Célula Única / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Nat Commun Assunto da revista: BIOLOGIA / CIENCIA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

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