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Bioinformatic pipelines combining denoising and clustering tools allow for more comprehensive prokaryotic and eukaryotic metabarcoding.
Brandt, Miriam I; Trouche, Blandine; Quintric, Laure; Günther, Babett; Wincker, Patrick; Poulain, Julie; Arnaud-Haond, Sophie.
Afiliação
  • Brandt MI; MARBEC, University of Montpellier, Ifremer, IRD, CNRS, Sète, France.
  • Trouche B; Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, University of Brest, Ifremer, CNRS, Plouzané, France.
  • Quintric L; Cellule Bioinformatique, Ifremer, Plouzané, France.
  • Günther B; MARBEC, University of Montpellier, Ifremer, IRD, CNRS, Sète, France.
  • Wincker P; Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Université of Evry, Université Paris-Saclay, Evry, France.
  • Poulain J; Research Federation for the study of Global Ocean Systems Ecology and Evolution, Paris, France.
  • Arnaud-Haond S; Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Université of Evry, Université Paris-Saclay, Evry, France.
Mol Ecol Resour ; 21(6): 1904-1921, 2021 Aug.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33835712
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Archaea / Biologia Computacional / Eucariotos / Código de Barras de DNA Taxonômico / DNA Ambiental Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Mol Ecol Resour Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: França
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Archaea / Biologia Computacional / Eucariotos / Código de Barras de DNA Taxonômico / DNA Ambiental Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Mol Ecol Resour Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: França