Inferring mammalian tissue-specific regulatory conservation by predicting tissue-specific differences in open chromatin.

Kaplow, Irene M; Schäffer, Daniel E; Wirthlin, Morgan E; Lawler, Alyssa J; Brown, Ashley R; Kleyman, Michael; Pfenning, Andreas R

Kaplow, Irene M; Schäffer, Daniel E; Wirthlin, Morgan E; Lawler, Alyssa J; Brown, Ashley R; Kleyman, Michael; Pfenning, Andreas R.

Afiliação

Kaplow IM; Department of Computational Biology, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA. ikaplow@cs.cmu.edu.
Schäffer DE; Neuroscience Institute, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA. ikaplow@cs.cmu.edu.
Wirthlin ME; Department of Computational Biology, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA.
Lawler AJ; Department of Computational Biology, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA.
Brown AR; Neuroscience Institute, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA.
Kleyman M; Neuroscience Institute, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA.
Pfenning AR; Department of Biology, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA.

BMC Genomics ; 23(1): 291, 2022 Apr 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35410163

Assuntos

Cromatina; Elementos Facilitadores Genéticos; Animais; Cromatina/genética; Humanos; Mamíferos/genética; Redes Neurais de Computação; Nucleotídeos

Palavras-chave

Enhancers; Gene expression evolution; Machine learning; Open chromatin prediction

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Cromatina / Elementos Facilitadores Genéticos Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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