Evaluation of the Bio-Evolution Microsporidia generic and typing real-time PCR assays for the diagnosis of intestinal microsporidiosis.

Title: Évaluation des tests de PCR en temps réel Bio-Evolution Microsporidia generic et typing pour le diagnostic de la microsporidiose intestinale. Abstract: Les microsporidioses intestinales sont des infections sous-estimées affectant à la fois les patients immunodéprimés et immunocompétents. Le diagnostic microscopique en laboratoire médical est aujourd'hui supplanté par la PCR en temps réel. Cependant, peu de fabricants incluent les microsporidies dans leurs panels PCR pour le diagnostic des gastro-entérites infectieuses. Ici, nous avons évalué les performances des tests PCR en temps réel microsporidia generic et microsporidia typing (Bio-Evolution, France) sur le thermocycleur PCR en temps réel Rotor-Gene Q (Qiagen, France). Nous avons inclus 45 échantillons de selles négatifs et 44 échantillons positifs pour Enterocytozoon bieneusi (n = 34, avec divers génotypes), Encephalitozoon intestinalis (n = 4), Encephalitozoon hellem (n = 4) et Encephalitozoon cuniculi (n = 2). Nous avons également analysé les résultats sur 4 ans d'un programme de contrôle qualité inter-laboratoires dont 9 centres ont utilisé ces kits commerciaux. La sensibilité et la spécificité du kit microsporidia generic étaient respectivement de 86,4 % et 93,3 %. Encephalitozoon hellem et E. cuniculi ont été détectés par le kit microsporidia generic mais pas par le kit microsporidia typing. Ces résultats étaient cohérents avec ceux du programme de contrôle de qualité inter-laboratoires. En conclusion, les tests de PCR en temps réel Bio-Evolution sont des outils intéressants pour la microsporidiose intestinale, mais un résultat négatif pour le test de typage microsporidia nécessite une analyse supplémentaire pour confirmer les infections à E. hellem ou E. cuniculi.