Detalles de la búsqueda
1.
Enabling structure-based drug discovery utilizing predicted models.
Cell
; 187(3): 521-525, 2024 Feb 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38306979
2.
FEP Protocol Builder: Optimization of Free Energy Perturbation Protocols Using Active Learning.
J Chem Inf Model
; 63(17): 5592-5603, 2023 09 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37594480
3.
Enhancing Hit Discovery in Virtual Screening through Absolute Protein-Ligand Binding Free-Energy Calculations.
J Chem Inf Model
; 63(10): 3171-3185, 2023 05 22.
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| MEDLINE | ID: mdl-37167486
4.
The Impact of Experimental and Calculated Error on the Performance of Affinity Predictions.
J Chem Inf Model
; 62(3): 703-717, 2022 02 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35061383
5.
AutoDesigner, a De Novo Design Algorithm for Rapidly Exploring Large Chemical Space for Lead Optimization: Application to the Design and Synthesis of d-Amino Acid Oxidase Inhibitors.
J Chem Inf Model
; 62(8): 1905-1915, 2022 04 25.
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| MEDLINE | ID: mdl-35417149
6.
From computer-aided drug discovery to computer-driven drug discovery.
Drug Discov Today Technol
; 39: 111-117, 2021 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34906321
7.
Is Structure-Based Drug Design Ready for Selectivity Optimization?
J Chem Inf Model
; 60(12): 6211-6227, 2020 12 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33119284
8.
Combining Cloud-Based Free-Energy Calculations, Synthetically Aware Enumerations, and Goal-Directed Generative Machine Learning for Rapid Large-Scale Chemical Exploration and Optimization.
J Chem Inf Model
; 60(9): 4311-4325, 2020 09 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32484669
9.
Application of Free Energy Perturbation (FEP+) to Understanding Ligand Selectivity: A Case Study to Assess Selectivity Between Pairs of Phosphodiesterases (PDE's).
J Chem Inf Model
; 59(6): 2729-2740, 2019 06 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31144815
10.
Molecular Structure Extraction from Documents Using Deep Learning.
J Chem Inf Model
; 59(3): 1017-1029, 2019 03 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30758950
11.
Toward Atomistic Modeling of Irreversible Covalent Inhibitor Binding Kinetics.
J Chem Inf Model
; 59(9): 3955-3967, 2019 09 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31425654
12.
Reaction-Based Enumeration, Active Learning, and Free Energy Calculations To Rapidly Explore Synthetically Tractable Chemical Space and Optimize Potency of Cyclin-Dependent Kinase 2 Inhibitors.
J Chem Inf Model
; 59(9): 3782-3793, 2019 09 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31404495
13.
Advancing Drug Discovery through Enhanced Free Energy Calculations.
Acc Chem Res
; 50(7): 1625-1632, 2017 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28677954
14.
Accurate and reliable prediction of relative ligand binding potency in prospective drug discovery by way of a modern free-energy calculation protocol and force field.
J Am Chem Soc
; 137(7): 2695-703, 2015 Feb 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25625324
15.
Accurate Binding Free Energy Predictions in Fragment Optimization.
J Chem Inf Model
; 55(11): 2411-20, 2015 Nov 23.
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| MEDLINE | ID: mdl-26457994
16.
Baseline Analysis of a Young α-1-Antitrypsin Deficiency Liver Disease Cohort Reveals Frequent Portal Hypertension.
J Pediatr Gastroenterol Nutr
; 61(1): 94-101, 2015 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25651489
17.
Docking covalent inhibitors: a parameter free approach to pose prediction and scoring.
J Chem Inf Model
; 54(7): 1932-40, 2014 Jul 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24916536
18.
Contributions of water transfer energy to protein-ligand association and dissociation barriers: Watermap analysis of a series of p38α MAP kinase inhibitors.
Proteins
; 81(9): 1509-26, 2013 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23468227
19.
Lead optimization mapper: automating free energy calculations for lead optimization.
J Comput Aided Mol Des
; 27(9): 755-70, 2013 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24072356
20.
Quantitatively Accounting for Protein Reorganization in Computer-Aided Drug Design.
J Chem Theory Comput
; 19(11): 3080-3090, 2023 Jun 13.
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| MEDLINE | ID: mdl-37219932