Detalles de la búsqueda
1.
Mitochondrial DNA drives abscopal responses to radiation that are inhibited by autophagy.
Nat Immunol
; 21(10): 1160-1171, 2020 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32747819
2.
Next-generation computational tools for interrogating cancer immunity.
Nat Rev Genet
; 20(12): 724-746, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31515541
3.
A community challenge to predict clinical outcomes after immune checkpoint blockade in non-small cell lung cancer.
J Transl Med
; 22(1): 190, 2024 Feb 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38383458
4.
SimBu: bias-aware simulation of bulk RNA-seq data with variable cell-type composition.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii141-ii147, 2022 09 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36124800
5.
nextNEOpi: a comprehensive pipeline for computational neoantigen prediction.
Bioinformatics
; 38(4): 1131-1132, 2022 01 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34788790
6.
NKG2A is a late immune checkpoint on CD8 T cells and marks repeated stimulation and cell division.
Int J Cancer
; 150(4): 688-704, 2022 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34716584
7.
Computational genomics tools for dissecting tumour-immune cell interactions.
Nat Rev Genet
; 17(8): 441-58, 2016 07 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27376489
8.
NeoFuse: predicting fusion neoantigens from RNA sequencing data.
Bioinformatics
; 36(7): 2260-2261, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31755900
9.
Scirpy: a Scanpy extension for analyzing single-cell T-cell receptor-sequencing data.
Bioinformatics
; 36(18): 4817-4818, 2020 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32614448
10.
Measuring the diversity of the human microbiota with targeted next-generation sequencing.
Brief Bioinform
; 19(4): 679-692, 2018 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28025179
11.
Comprehensive evaluation of transcriptome-based cell-type quantification methods for immuno-oncology.
Bioinformatics
; 35(14): i436-i445, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510660
12.
Optimizing PCR primers targeting the bacterial 16S ribosomal RNA gene.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 343, 2018 Sep 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30268091
13.
Quantifying tumor-infiltrating immune cells from transcriptomics data.
Cancer Immunol Immunother
; 67(7): 1031-1040, 2018 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29541787
14.
TIminer: NGS data mining pipeline for cancer immunology and immunotherapy.
Bioinformatics
; 33(19): 3140-3141, 2017 Oct 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28633385
15.
Global genomic and transcriptomic analysis of human pancreatic islets reveals novel genes influencing glucose metabolism.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(38): 13924-9, 2014 Sep 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25201977
16.
FunPat: function-based pattern analysis on RNA-seq time series data.
BMC Genomics
; 16: S2, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26046293
17.
Reducing bias in RNA sequencing data: a novel approach to compute counts.
BMC Bioinformatics
; 15 Suppl 1: S7, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24564404
18.
Comparative analysis of algorithms for whole-genome assembly of pyrosequencing data.
Brief Bioinform
; 13(3): 269-80, 2012 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22021898
19.
Next-generation deconvolution of transcriptomic data to investigate the tumor microenvironment.
Int Rev Cell Mol Biol
; 382: 103-143, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38225101
20.
Making mouse transcriptomics deconvolution accessible with immunedeconv.
Bioinform Adv
; 4(1): vbae032, 2024.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38464974