Detalles de la búsqueda
1.
Extended Metadynamics Protocol for Binding/Unbinding Free Energies of Peptide Ligands to Class A G-Protein-Coupled Receptors.
J Chem Inf Model
; 64(1): 205-218, 2024 Jan 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38150388
2.
Role of glutamine synthetase in angiogenesis beyond glutamine synthesis.
Nature
; 561(7721): 63-69, 2018 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30158707
3.
Mechanistic Insights into the Ligand-Induced Unfolding of an RNA G-Quadruplex.
J Am Chem Soc
; 144(2): 935-950, 2022 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34989224
4.
Investigating Cryptic Binding Sites by Molecular Dynamics Simulations.
Acc Chem Res
; 53(3): 654-661, 2020 03 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32134250
5.
Understanding Ligand Binding Selectivity in a Prototypical GPCR Family.
J Chem Inf Model
; 59(6): 2830-2836, 2019 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31125224
6.
Protein CoAlation and antioxidant function of coenzyme A in prokaryotic cells.
Biochem J
; 475(11): 1909-1937, 2018 06 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29626155
7.
Understanding Cryptic Pocket Formation in Protein Targets by Enhanced Sampling Simulations.
J Am Chem Soc
; 138(43): 14257-14263, 2016 11 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27726386
8.
Investigating drug-target association and dissociation mechanisms using metadynamics-based algorithms.
Acc Chem Res
; 48(2): 277-85, 2015 Feb 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25496113
9.
Towards a Molecular Understanding of the Link between Imatinib Resistance and Kinase Conformational Dynamics.
PLoS Comput Biol
; 11(11): e1004578, 2015 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26606374
10.
A Three-Site Mechanism for Agonist/Antagonist Selective Binding to Vasopressin Receptors.
Angew Chem Int Ed Engl
; 55(28): 8008-12, 2016 07 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27184628
11.
The SH2 domain regulates c-Abl kinase activation by a cyclin-like mechanism and remodulation of the hinge motion.
PLoS Comput Biol
; 10(10): e1003863, 2014 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25299346
12.
Drug-resistant EGFR mutations promote lung cancer by stabilizing interfaces in ligand-free kinase-active EGFR oligomers.
Nat Commun
; 15(1): 2130, 2024 Mar 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38503739
13.
Molecular basis of engineered meganuclease targeting of the endogenous human RAG1 locus.
Nucleic Acids Res
; 39(2): 729-43, 2011 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20846960
14.
The different flexibility of c-Src and c-Abl kinases regulates the accessibility of a druggable inactive conformation.
J Am Chem Soc
; 134(5): 2496-9, 2012 Feb 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22280319
15.
Aromatic side-chain flips orchestrate the conformational sampling of functional loops in human histone deacetylase 8.
Chem Sci
; 12(27): 9318-9327, 2021 Jul 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34349901
16.
Combining Machine Learning and Enhanced Sampling Techniques for Efficient and Accurate Calculation of Absolute Binding Free Energies.
J Chem Theory Comput
; 16(7): 4641-4654, 2020 Jul 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32427471
17.
Bifunctional catalysis by natural cinchona alkaloids: a mechanism explained.
Chemistry
; 15(32): 7913-7921, 2009 Aug 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19492372
18.
Defining an Optimal Metric for the Path Collective Variables.
J Chem Theory Comput
; 15(1): 25-32, 2019 Jan 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30468578
19.
Importance of the Force Field Choice in Capturing Functionally Relevant Dynamics in the von Willebrand Factor.
J Phys Chem Lett
; 10(8): 1928-1934, 2019 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30933516
20.
Structure and Dynamics of the EGF Receptor as Revealed by Experiments and Simulations and Its Relevance to Non-Small Cell Lung Cancer.
Cells
; 8(4)2019 04 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30959819