Detalles de la búsqueda
1.
Epitranscriptomics in parasitic protists: Role of RNA chemical modifications in posttranscriptional gene regulation.
PLoS Pathog
; 18(12): e1010972, 2022 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36548245
2.
Nm-Nano: a machine learning framework for transcriptome-wide single-molecule mapping of 2´-O-methylation (Nm) sites in nanopore direct RNA sequencing datasets.
RNA Biol
; 21(1): 1-15, 2024 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38758523
3.
Read-depth based approach on whole genome resequencing data reveals important insights into the copy number variation (CNV) map of major global buffalo breeds.
BMC Genomics
; 24(1): 616, 2023 Oct 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37845620
4.
Penguin: A tool for predicting pseudouridine sites in direct RNA nanopore sequencing data.
Methods
; 203: 478-487, 2022 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35182749
5.
CASowary: CRISPR-Cas13 guide RNA predictor for transcript depletion.
BMC Genomics
; 23(1): 172, 2022 Mar 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35236300
6.
Esophageal Microbiome in Healthy Children and Esophageal Eosinophilia.
J Pediatr Gastroenterol Nutr
; 74(5): e109-e114, 2022 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35149653
7.
Lantern: an integrative repository of functional annotations for lncRNAs in the human genome.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 279, 2021 May 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34039271
8.
Sequoia: an interactive visual analytics platform for interpretation and feature extraction from nanopore sequencing datasets.
BMC Genomics
; 22(1): 513, 2021 Jul 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34233619
9.
SliceIt: A genome-wide resource and visualization tool to design CRISPR/Cas9 screens for editing protein-RNA interaction sites in the human genome.
Methods
; 178: 104-113, 2020 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31494246
10.
Bcl6 and Blimp1 reciprocally regulate ST2+ Treg-cell development in the context of allergic airway inflammation.
J Allergy Clin Immunol
; 146(5): 1121-1136.e9, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32179158
11.
DNA sequence preferences of transcriptional activators correlate more strongly than repressors with nucleosomes.
Mol Cell
; 47(2): 183-92, 2012 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22841002
12.
Role of SARS-CoV-2 in Altering the RNA-Binding Protein and miRNA-Directed Post-Transcriptional Regulatory Networks in Humans.
Int J Mol Sci
; 21(19)2020 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32993015
13.
Human protein-RNA interaction network is highly stable across mammals.
BMC Genomics
; 20(Suppl 12): 1004, 2019 Dec 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31888461
14.
Seten: a tool for systematic identification and comparison of processes, phenotypes, and diseases associated with RNA-binding proteins from condition-specific CLIP-seq profiles.
RNA
; 23(6): 836-846, 2017 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28336542
15.
Paracrine IL-2 Is Required for Optimal Type 2 Effector Cytokine Production.
J Immunol
; 198(11): 4352-4359, 2017 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28468971
16.
Express: A database of transcriptome profiles encompassing known and novel transcripts across multiple development stages in eye tissues.
Exp Eye Res
; 168: 57-68, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29337142
17.
Mutational landscape of RNA-binding proteins in human cancers.
RNA Biol
; 15(1): 115-129, 2018 01 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29023197
18.
PSIP1/p75 promotes tumorigenicity in breast cancer cells by promoting the transcription of cell cycle genes.
Carcinogenesis
; 38(10): 966-975, 2017 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28633434
19.
Benchmarking of de novo assembly algorithms for Nanopore data reveals optimal performance of OLC approaches.
BMC Genomics
; 17 Suppl 7: 507, 2016 08 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27556636
20.
Expression levels of SF3B3 correlate with prognosis and endocrine resistance in estrogen receptor-positive breast cancer.
Mod Pathol
; 28(5): 677-85, 2015 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25431237