Detalles de la búsqueda
1.
Mammalian oocytes store proteins for the early embryo on cytoplasmic lattices.
Cell
; 186(24): 5308-5327.e25, 2023 11 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37922900
2.
inSPIRE: An Open-Source Tool for Increased Mass Spectrometry Identification Rates Using Prosit Spectral Prediction.
Mol Cell Proteomics
; 21(12): 100432, 2022 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36280141
3.
iBench: A ground truth approach for advanced validation of mass spectrometry identification method.
Proteomics
; 23(2): e2200271, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36189881
4.
Database search engines and target database features impinge upon the identification of post-translationally cis-spliced peptides in HLA class I immunopeptidomes.
Proteomics
; 22(10): e2100226, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35184383
5.
ER-aminopeptidase 1 determines the processing and presentation of an immunotherapy-relevant melanoma epitope.
Eur J Immunol
; 50(2): 270-283, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31729751
6.
Proteolytic dynamics of human 20S thymoproteasome.
J Biol Chem
; 294(19): 7740-7754, 2019 05 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30914481
7.
Post-Translational Peptide Splicing and T Cell Responses.
Trends Immunol
; 38(12): 904-915, 2017 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28830734
8.
PEITH(Θ): perfecting experiments with information theory in Python with GPU support.
Bioinformatics
; 34(7): 1249-1250, 2018 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29228182
9.
Single Cell Phenotyping Reveals Heterogeneity Among Hematopoietic Stem Cells Following Infection.
Stem Cells
; 35(11): 2292-2304, 2017 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28833970
10.
CD8(+) T cells of Listeria monocytogenes-infected mice recognize both linear and spliced proteasome products.
Eur J Immunol
; 46(5): 1109-18, 2016 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26909514
11.
Information theory and signal transduction systems: from molecular information processing to network inference.
Semin Cell Dev Biol
; 35: 98-108, 2014 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24953199
12.
The T210M Substitution in the HLA-a*02:01 gp100 Epitope Strongly Affects Overall Proteasomal Cleavage Site Usage and Antigen Processing.
J Biol Chem
; 290(51): 30417-28, 2015 Dec 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26507656
13.
Proteasome isoforms exhibit only quantitative differences in cleavage and epitope generation.
Eur J Immunol
; 44(12): 3508-21, 2014 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25231383
14.
Inference of random walk models to describe leukocyte migration.
Phys Biol
; 12(6): 066001, 2015 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26403334
15.
Maximizing the information content of experiments in systems biology.
PLoS Comput Biol
; 9(1): e1002888, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23382663
16.
Protein degradation by human 20S proteasomes elucidates the interplay between peptide hydrolysis and splicing.
Nat Commun
; 15(1): 1147, 2024 Feb 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38326304
17.
P38 and JNK have opposing effects on persistence of in vivo leukocyte migration in zebrafish.
Immunol Cell Biol
; 91(1): 60-9, 2013 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23165607
18.
InvitroSPI and a large database of proteasome-generated spliced and non-spliced peptides.
Sci Data
; 10(1): 18, 2023 01 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36627305
19.
GPU accelerated biochemical network simulation.
Bioinformatics
; 27(6): 874-6, 2011 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21224286
20.
Predicting the Success of Fmoc-Based Peptide Synthesis.
ACS Omega
; 7(27): 23771-23781, 2022 Jul 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35847273