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1.

Two Forkhead transcription factors regulate cardiac progenitor specification by controlling the expression of receptors of the fibroblast growth factor and Wnt signaling pathways.

Ahmad, Shaad M; Bhattacharyya, Pritha; Jeffries, Neal; Gisselbrecht, Stephen S; Michelson, Alan M.

Development ; 143(2): 306-17, 2016 Jan 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26657774

2.

Machine learning classification of cell-specific cardiac enhancers uncovers developmental subnetworks regulating progenitor cell division and cell fate specification.

Ahmad, Shaad M; Busser, Brian W; Huang, Di; Cozart, Elizabeth J; Michaud, Sébastien; Zhu, Xianmin; Jeffries, Neal; Aboukhalil, Anton; Bulyk, Martha L; Ovcharenko, Ivan; Michelson, Alan M.

Development ; 141(4): 878-88, 2014 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24496624

3.

Enhancer modeling uncovers transcriptional signatures of individual cardiac cell states in Drosophila.

Busser, Brian W; Haimovich, Julian; Huang, Di; Ovcharenko, Ivan; Michelson, Alan M.

Nucleic Acids Res ; 43(3): 1726-39, 2015 Feb 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25609699

4.

Highly parallel assays of tissue-specific enhancers in whole Drosophila embryos.

Gisselbrecht, Stephen S; Barrera, Luis A; Porsch, Martin; Aboukhalil, Anton; Estep, Preston W; Vedenko, Anastasia; Palagi, Alexandre; Kim, Yongsok; Zhu, Xianmin; Busser, Brian W; Gamble, Caitlin E; Iagovitina, Antonina; Singhania, Aditi; Michelson, Alan M; Bulyk, Martha L.

Nat Methods ; 10(8): 774-80, 2013 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23852450

5.

Molecular mechanism underlying the regulatory specificity of a Drosophila homeodomain protein that specifies myoblast identity.

Busser, Brian W; Shokri, Leila; Jaeger, Savina A; Gisselbrecht, Stephen S; Singhania, Aditi; Berger, Michael F; Zhou, Bo; Bulyk, Martha L; Michelson, Alan M.

Development ; 139(6): 1164-74, 2012 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22296846

6.

Differential regulation of mesodermal gene expression by Drosophila cell type-specific Forkhead transcription factors.

Zhu, Xianmin; Ahmad, Shaad M; Aboukhalil, Anton; Busser, Brian W; Kim, Yongsok; Tansey, Terese R; Haimovich, Adrian; Jeffries, Neal; Bulyk, Martha L; Michelson, Alan M.

Development ; 139(8): 1457-66, 2012 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22378636

7.

A machine learning approach for identifying novel cell type-specific transcriptional regulators of myogenesis.

Busser, Brian W; Taher, Leila; Kim, Yongsok; Tansey, Terese; Bloom, Molly J; Ovcharenko, Ivan; Michelson, Alan M.

PLoS Genet ; 8(3): e1002531, 2012.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22412381

8.

Integrative analysis of the zinc finger transcription factor Lame duck in the Drosophila myogenic gene regulatory network.

Busser, Brian W; Huang, Di; Rogacki, Kevin R; Lane, Elizabeth A; Shokri, Leila; Ni, Ting; Gamble, Caitlin E; Gisselbrecht, Stephen S; Zhu, Jun; Bulyk, Martha L; Ovcharenko, Ivan; Michelson, Alan M.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 109(50): 20768-73, 2012 Dec 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23184988

9.

Multi-step control of muscle diversity by Hox proteins in the Drosophila embryo.

Enriquez, Jonathan; Boukhatmi, Hadi; Dubois, Laurence; Philippakis, Anthony A; Bulyk, Martha L; Michelson, Alan M; Crozatier, Michèle; Vincent, Alain.

Development ; 137(3): 457-66, 2010 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20056681

10.

An integrated strategy for analyzing the unique developmental programs of different myoblast subtypes.

Estrada, Beatriz; Choe, Sung E; Gisselbrecht, Stephen S; Michaud, Sebastien; Raj, Lakshmi; Busser, Brian W; Halfon, Marc S; Church, George M; Michelson, Alan M.

PLoS Genet ; 2(2): e16, 2006 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16482229

11.

A genomic approach to myoblast fusion in Drosophila.

Estrada, Beatriz; Michelson, Alan M.

Methods Mol Biol ; 475: 299-314, 2008.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18979251

12.

Expression-guided in silico evaluation of candidate cis regulatory codes for Drosophila muscle founder cells.

Philippakis, Anthony A; Busser, Brian W; Gisselbrecht, Stephen S; He, Fangxue Sherry; Estrada, Beatriz; Michelson, Alan M; Bulyk, Martha L.

PLoS Comput Biol ; 2(5): e53, 2006 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16733548

13.

Running interference for hedgehog signaling.

Michelson, Alan M.

Sci STKE ; 2003(192): PE30, 2003 Jul 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12881613

14.

An Orthologous Epigenetic Gene Expression Signature Derived from Differentiating Embryonic Stem Cells Identifies Regulators of Cardiogenesis.

Busser, Brian W; Lin, Yongshun; Yang, Yanqin; Zhu, Jun; Chen, Guokai; Michelson, Alan M.

PLoS One ; 10(10): e0141066, 2015.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26485529

15.

Exploring genetic regulatory networks in metazoan development: methods and models.

Halfon, Marc S; Michelson, Alan M.

Physiol Genomics ; 10(3): 131-43, 2002 Sep 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12209016

16.

Contribution of distinct homeodomain DNA binding specificities to Drosophila embryonic mesodermal cell-specific gene expression programs.

Busser, Brian W; Gisselbrecht, Stephen S; Shokri, Leila; Tansey, Terese R; Gamble, Caitlin E; Bulyk, Martha L; Michelson, Alan M.

PLoS One ; 8(7): e69385, 2013.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23922708

17.

Biological code breaking in the 21st century.

Michelson, Alan M; Bulyk, Martha L.

Mol Syst Biol ; 2: 2006.0018, 2006.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16738563

18.

Two forkhead transcription factors regulate the division of cardiac progenitor cells by a Polo-dependent pathway.

Ahmad, Shaad M; Tansey, Terese R; Busser, Brian W; Nolte, Michael T; Jeffries, Neal; Gisselbrecht, Stephen S; Rusan, Nasser M; Michelson, Alan M.

Dev Cell ; 23(1): 97-111, 2012 Jul 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22814603

19.

Toward a systems-level understanding of developmental regulatory networks.

Busser, Brian W; Bulyk, Martha L; Michelson, Alan M.

Curr Opin Genet Dev ; 18(6): 521-9, 2008 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18848887

20.

The transmembrane protein Perdido interacts with Grip and integrins to mediate myotube projection and attachment in the Drosophila embryo.

Estrada, Beatriz; Gisselbrecht, Stephen S; Michelson, Alan M.

Development ; 134(24): 4469-78, 2007 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18039972

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