Detalles de la búsqueda
1.
Use of High-Resolution Geospatial and Genomic Data to Characterize Recent Tuberculosis Transmission, Botswana.
Emerg Infect Dis
; 29(5): 977-987, 2023 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37081530
2.
A linear noise approximation for stochastic epidemic models fit to partially observed incidence counts.
Biometrics
; 78(4): 1530-1541, 2022 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34374071
3.
Predictors of Test Positivity, Mortality, and Seropositivity during the Early Coronavirus Disease Epidemic, Orange County, California, USA.
Emerg Infect Dis
; 27(10): 2604-2618, 2021 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34545792
4.
19 Dubious Ways to Compute the Marginal Likelihood of a Phylogenetic Tree Topology.
Syst Biol
; 69(2): 209-220, 2020 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31504998
5.
A Bayesian phylogenetic hidden Markov model for B cell receptor sequence analysis.
PLoS Comput Biol
; 16(8): e1008030, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32804924
6.
Locally adaptive Bayesian birth-death model successfully detects slow and rapid rate shifts.
PLoS Comput Biol
; 16(10): e1007999, 2020 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33112848
7.
Estimating effective population size changes from preferentially sampled genetic sequences.
PLoS Comput Biol
; 16(10): e1007774, 2020 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33044955
8.
Horseshoe-based Bayesian nonparametric estimation of effective population size trajectories.
Biometrics
; 76(3): 677-690, 2020 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32277713
9.
Myosin-independent cytokinesis in Giardia utilizes flagella to coordinate force generation and direct membrane trafficking.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(29): E5854-E5863, 2017 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28679631
10.
Using Genotype Abundance to Improve Phylogenetic Inference.
Mol Biol Evol
; 35(5): 1253-1265, 2018 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29474671
11.
Predicting B cell receptor substitution profiles using public repertoire data.
PLoS Comput Biol
; 14(10): e1006388, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30332400
12.
Recombination-independent rapid convergent evolution of the gastric pathogen Helicobacter pylori.
BMC Genomics
; 19(1): 835, 2018 Nov 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30463511
13.
Birth/birth-death processes and their computable transition probabilities with biological applications.
J Math Biol
; 76(4): 911-944, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28741177
14.
Detecting the Anomaly Zone in Species Trees and Evidence for a Misleading Signal in Higher-Level Skink Phylogeny (Squamata: Scincidae).
Syst Biol
; 65(3): 465-77, 2016 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26738927
15.
Quantifying and Mitigating the Effect of Preferential Sampling on Phylodynamic Inference.
PLoS Comput Biol
; 12(3): e1004789, 2016 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26938243
16.
Predictable transcriptome evolution in the convergent and complex bioluminescent organs of squid.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(44): E4736-42, 2014 Nov 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25336755
17.
An efficient Bayesian inference framework for coalescent-based nonparametric phylodynamics.
Bioinformatics
; 31(20): 3282-9, 2015 Oct 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26093147
18.
Synonymous and nonsynonymous distances help untangle convergent evolution and recombination.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 14(4): 375-89, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26061623
19.
Species delimitation using genome-wide SNP data.
Syst Biol
; 63(4): 534-42, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24627183
20.
Likelihood-based inference for discretely observed birth-death-shift processes, with applications to evolution of mobile genetic elements.
Biometrics
; 71(4): 1009-21, 2015 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26148963