Detalles de la búsqueda
1.
ICEberg 3.0: functional categorization and analysis of the integrative and conjugative elements in bacteria.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D732-D737, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37870467
2.
TADB 3.0: an updated database of bacterial toxin-antitoxin loci and associated mobile genetic elements.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D784-D790, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37897352
3.
T4SEfinder: a bioinformatics tool for genome-scale prediction of bacterial type IV secreted effectors using pre-trained protein language model.
Brief Bioinform
; 23(1)2022 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34657153
4.
VRprofile2: detection of antibiotic resistance-associated mobilome in bacterial pathogens.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W768-W773, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35524563
5.
Antibiotic-induced degradation of antitoxin enhances the transcription of acetyltransferase-type toxin-antitoxin operon.
J Antimicrob Chemother
; 78(4): 1066-1075, 2023 04 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36857516
6.
ICEberg 2.0: an updated database of bacterial integrative and conjugative elements.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D660-D665, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30407568
7.
Toxin-antitoxin operon kacAT of Klebsiella pneumoniae is regulated by conditional cooperativity via a W-shaped KacA-KacT complex.
Nucleic Acids Res
; 47(14): 7690-7702, 2019 08 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31260525
8.
Absence of the type I-E CRISPR-Cas system in Klebsiella pneumoniae clonal complex 258 is associated with dissemination of IncF epidemic resistance plasmids in this clonal complex.
J Antimicrob Chemother
; 75(4): 890-895, 2020 04 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32003793
9.
VRprofile: gene-cluster-detection-based profiling of virulence and antibiotic resistance traits encoded within genome sequences of pathogenic bacteria.
Brief Bioinform
; 19(4): 566-574, 2018 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28077405
10.
oriTfinder: a web-based tool for the identification of origin of transfers in DNA sequences of bacterial mobile genetic elements.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W229-W234, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29733379
11.
TADB 2.0: an updated database of bacterial type II toxin-antitoxin loci.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D749-D753, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29106666
12.
Identification and characterization of acetyltransferase-type toxin-antitoxin locus in Klebsiella pneumoniae.
Mol Microbiol
; 108(4): 336-349, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29461656
13.
Large-Scale Identification of AbaR-Type Genomic Islands in Acinetobacter baumannii Reveals Diverse Insertion Sites and Clonal Lineage-Specific Antimicrobial Resistance Gene Profiles.
Antimicrob Agents Chemother
; 63(4)2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30917986
14.
Type VI secretion system contributes to Enterohemorrhagic Escherichia coli virulence by secreting catalase against host reactive oxygen species (ROS).
PLoS Pathog
; 13(3): e1006246, 2017 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28288207
15.
In Silico Typing and Comparative Genomic Analysis of IncFIIK Plasmids and Insights into the Evolution of Replicons, Plasmid Backbones, and Resistance Determinant Profiles.
Antimicrob Agents Chemother
; 62(10)2018 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30012771
16.
Large-Scale Transposition Mutagenesis of Streptomyces coelicolor Identifies Hundreds of Genes Influencing Antibiotic Biosynthesis.
Appl Environ Microbiol
; 83(6)2017 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28062460
17.
PDC-SGB: Prediction of effective drug combinations using a stochastic gradient boosting algorithm.
J Theor Biol
; 417: 1-7, 2017 03 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28099868
18.
Recognition and cleavage of 5-methylcytosine DNA by bacterial SRA-HNH proteins.
Nucleic Acids Res
; 43(2): 1147-59, 2015 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25564526
19.
The dnd operon for DNA phosphorothioation modification system in Escherichia coli is located in diverse genomic islands.
BMC Genomics
; 16: 199, 2015 Mar 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25879448
20.
First report of a clinical, multidrug-resistant Enterobacteriaceae isolate coharboring fosfomycin resistance gene fosA3 and carbapenemase gene blaKPC-2 on the same transposon, Tn1721.
Antimicrob Agents Chemother
; 59(1): 338-43, 2015 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25367902