Detalles de la búsqueda
1.
Enabling structure-based drug discovery utilizing predicted models.
Cell
; 187(3): 521-525, 2024 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38306979
2.
A Structural Change in Butyrophilin upon Phosphoantigen Binding Underlies Phosphoantigen-Mediated Vγ9Vδ2 T Cell Activation.
Immunity
; 50(4): 1043-1053.e5, 2019 04 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30902636
3.
Dynamic extracellular vestibule of human SERT: Unveiling druggable potential with high-affinity allosteric inhibitors.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(41): e2304089120, 2023 10 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37792512
4.
Enhancing Hit Discovery in Virtual Screening through Absolute Protein-Ligand Binding Free-Energy Calculations.
J Chem Inf Model
; 63(10): 3171-3185, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37167486
5.
The Impact of Experimental and Calculated Error on the Performance of Affinity Predictions.
J Chem Inf Model
; 62(3): 703-717, 2022 02 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35061383
6.
Novel Physics-Based Ensemble Modeling Approach That Utilizes 3D Molecular Conformation and Packing to Access Aqueous Thermodynamic Solubility: A Case Study of Orally Available Bromodomain and Extraterminal Domain Inhibitor Lead Optimization Series.
J Chem Inf Model
; 61(3): 1412-1426, 2021 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33661005
7.
Improving the Accuracy of Protein Thermostability Predictions for Single Point Mutations.
Biophys J
; 119(1): 115-127, 2020 07 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32533939
8.
Is Structure-Based Drug Design Ready for Selectivity Optimization?
J Chem Inf Model
; 60(12): 6211-6227, 2020 12 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33119284
9.
Evaluation of Free Energy Calculations for the Prioritization of Macrocycle Synthesis.
J Chem Inf Model
; 60(7): 3489-3498, 2020 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32539379
10.
Toward Atomistic Modeling of Irreversible Covalent Inhibitor Binding Kinetics.
J Chem Inf Model
; 59(9): 3955-3967, 2019 09 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31425654
11.
Advancing Drug Discovery through Enhanced Free Energy Calculations.
Acc Chem Res
; 50(7): 1625-1632, 2017 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28677954
12.
Efficient sampling of puckering states of monosaccharides through replica exchange with solute tempering and bond softening.
J Chem Phys
; 149(7): 072306, 2018 Aug 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30134707
13.
Accurate and reliable prediction of relative ligand binding potency in prospective drug discovery by way of a modern free-energy calculation protocol and force field.
J Am Chem Soc
; 137(7): 2695-703, 2015 Feb 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25625324
14.
Is ring breaking feasible in relative binding free energy calculations?
J Chem Inf Model
; 55(4): 727-35, 2015 Apr 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25835054
15.
Accurate Binding Free Energy Predictions in Fragment Optimization.
J Chem Inf Model
; 55(11): 2411-20, 2015 Nov 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26457994
16.
On achieving high accuracy and reliability in the calculation of relative protein-ligand binding affinities.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(6): 1937-42, 2012 Feb 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22308365
17.
Ligand binding to protein-binding pockets with wet and dry regions.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(4): 1326-30, 2011 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21205906
18.
Robust prediction of relative binding energies for protein-protein complex mutations using free energy perturbation calculations.
bioRxiv
; 2024 Apr 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38712280
19.
Robust prediction of relative binding energies for protein-protein complex mutations using free energy perturbation calculations.
J Mol Biol
; : 168640, 2024 Jun 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38844044
20.
Quantitatively Accounting for Protein Reorganization in Computer-Aided Drug Design.
J Chem Theory Comput
; 19(11): 3080-3090, 2023 Jun 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37219932