Detalles de la búsqueda
1.
Defining T Cell States Associated with Response to Checkpoint Immunotherapy in Melanoma.
Cell
; 175(4): 998-1013.e20, 2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30388456
2.
Core Circadian Clock Genes Regulate Leukemia Stem Cells in AML.
Cell
; 165(2): 303-16, 2016 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27058663
3.
Hold out the genome: a roadmap to solving the cis-regulatory code.
Nature
; 625(7993): 41-50, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38093018
4.
Defining T Cell States Associated with Response to Checkpoint Immunotherapy in Melanoma.
Cell
; 176(1-2): 404, 2019 Jan 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30633907
5.
The evolution, evolvability and engineering of gene regulatory DNA.
Nature
; 603(7901): 455-463, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35264797
6.
Post-translational modification-centric base editor screens to assess phosphorylation site functionality in high throughput.
Nat Methods
; 21(6): 1033-1043, 2024 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38684783
7.
The continuum of transcription factor affinities.
Nat Rev Genet
; 25(6): 378, 2024 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38413844
8.
Systematic identification of genomic elements that regulate FCGR2A expression and harbor variants linked with autoimmune disease.
Hum Mol Genet
; 31(12): 1946-1961, 2022 06 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34970970
9.
LegNet: a best-in-class deep learning model for short DNA regulatory regions.
Bioinformatics
; 39(8)2023 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37490428
10.
GIL: a python package for designing custom indexing primers.
Bioinformatics
; 39(6)2023 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37208164
11.
BROCKMAN: deciphering variance in epigenomic regulators by k-mer factorization.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 253, 2018 07 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29970004
12.
A unified model for yeast transcript definition.
Genome Res
; 24(1): 154-66, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24170600
13.
YeTFaSCo: a database of evaluated yeast transcription factor sequence specificities.
Nucleic Acids Res
; 40(Database issue): D169-79, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22102575
14.
Regulatory activity is the default DNA state in eukaryotes.
Nat Struct Mol Biol
; 31(3): 559-567, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38448573
15.
Evaluation and optimization of sequence-based gene regulatory deep learning models.
bioRxiv
; 2024 Feb 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38405704
16.
Proteome-wide base editor screens to assess phosphorylation site functionality in high-throughput.
bioRxiv
; 2023 Nov 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38014346
17.
Prioritization of autoimmune disease-associated genetic variants that perturb regulatory element activity in T cells.
Nat Genet
; 54(5): 603-612, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35513721
18.
Global discovery of lupus genetic risk variant allelic enhancer activity.
Nat Commun
; 12(1): 1611, 2021 03 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33712590
19.
MAUDE: inferring expression changes in sorting-based CRISPR screens.
Genome Biol
; 21(1): 134, 2020 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32493396
20.
Author Correction: Deciphering eukaryotic gene-regulatory logic with 100 million random promoters.
Nat Biotechnol
; 38(10): 1211, 2020 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32792646