De novo motif identification improves the accuracy of predicting transcription factor binding sites in ChIP-Seq data analysis.

Boeva, Valentina; Surdez, Didier; Guillon, Noëlle; Tirode, Franck; Fejes, Anthony P; Delattre, Olivier; Barillot, Emmanuel

Boeva, Valentina; Surdez, Didier; Guillon, Noëlle; Tirode, Franck; Fejes, Anthony P; Delattre, Olivier; Barillot, Emmanuel.

Afiliación

Boeva V; Institut Curie, 26 rue d'Ulm, Paris, France.

Nucleic Acids Res ; 38(11): e126, 2010 Jun.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-20375099

Asunto(s)

Algoritmos; Inmunoprecipitación de Cromatina/métodos; Elementos Reguladores de la Transcripción; Análisis de Secuencia de ADN; Factores de Transcripción/metabolismo; Secuencia de Bases; Sitios de Unión; Línea Celular Tumoral; Secuencia de Consenso; Humanos; Proteínas de Fusión Oncogénica/metabolismo; Proteína Proto-Oncogénica c-fli-1/metabolismo; Proteína EWS de Unión a ARN

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Factores de Transcripción / Algoritmos / Análisis de Secuencia de ADN / Inmunoprecipitación de Cromatina / Elementos Reguladores de la Transcripción Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Evaluation_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Año: 2010 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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