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A competent catalytic active site is necessary for substrate induced dimer assembly in triosephosphate isomerase.
Jimenez-Sandoval, Pedro; Vique-Sanchez, Jose Luis; Hidalgo, Marisol López; Velazquez-Juarez, Gilberto; Diaz-Quezada, Corina; Arroyo-Navarro, Luis Fernando; Moran, Gabriela Montero; Fattori, Juliana; Jessica Diaz-Salazar, A; Rudiño-Pinera, Enrique; Sotelo-Mundo, Rogerio; Figueira, Ana Carolina Migliorini; Lara-Gonzalez, Samuel; Benítez-Cardoza, Claudia G; Brieba, Luis G.
Afiliación
  • Jimenez-Sandoval P; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Apartado Postal 629, Irapuato, CP 36821 Guanajuato, Mexico.
  • Vique-Sanchez JL; Laboratorio de Investigación Bioquímica, Programa Institucional en Biomedicina Molecular ENMyH-IPN, Guillermo Massieu Helguera No. 239, La Escalera Ticoman, 07320 DF, Mexico.
  • Hidalgo ML; Laboratorio de Investigación Bioquímica, Programa Institucional en Biomedicina Molecular ENMyH-IPN, Guillermo Massieu Helguera No. 239, La Escalera Ticoman, 07320 DF, Mexico.
  • Velazquez-Juarez G; Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías, Departamento de Química, Blvd. Marcelino García Barragán, Ciudad Universitaria, 44430 Guadalajara, Mexico.
  • Diaz-Quezada C; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Apartado Postal 629, Irapuato, CP 36821 Guanajuato, Mexico.
  • Arroyo-Navarro LF; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Apartado Postal 629, Irapuato, CP 36821 Guanajuato, Mexico.
  • Moran GM; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Apartado Postal 629, Irapuato, CP 36821 Guanajuato, Mexico.
  • Fattori J; Laboratório Nacional de Biociências-LNBio/Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais-CNPEM, Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, No. 10.000-Guara, Caixa Postal 6192, CEP 13083-970, Campinas-SP, Brazil.
  • Jessica Diaz-Salazar A; Laboratorio de Biofisicoquímica, Departamento de Fisicoquímica, Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México,Ciudad de México 04510, México.
  • Rudiño-Pinera E; Instituto de Biotecnologia, UNAM, Av. Universidad 2001, Chamilpa, 62210 Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Sotelo-Mundo R; Laboratorio de Estructura Biomolecular, Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. (CIAD), Carretera a Ejido La Victoria Km 0.6, Apartado Postal 1735, Hermosillo, Sonora 83304, Mexico.
  • Figueira ACM; Laboratório Nacional de Biociências-LNBio/Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais-CNPEM, Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, No. 10.000-Guara, Caixa Postal 6192, CEP 13083-970, Campinas-SP, Brazil.
  • Lara-Gonzalez S; IPICYT, División de Biología Molecular, Camino a la Presa San José 2055, CP 78216 San Luis Potosí, San Luis Potosí, Mexico.
  • Benítez-Cardoza CG; Laboratorio de Investigación Bioquímica, Programa Institucional en Biomedicina Molecular ENMyH-IPN, Guillermo Massieu Helguera No. 239, La Escalera Ticoman, 07320 DF, Mexico.
  • Brieba LG; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Apartado Postal 629, Irapuato, CP 36821 Guanajuato, Mexico. Electronic address: luis.brieba@cinvestav.mx.
Biochim Biophys Acta Proteins Proteom ; 1865(11 Pt A): 1423-1432, 2017 Nov.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28803140
ABSTRACT
The protozoan parasite Trichomonas vaginalis contains two nearly identical triosephosphate isomerases (TvTIMs) that dissociate into stable monomers and dimerize upon substrate binding. Herein, we compare the role of the "ball and socket" and loop 3 interactions in substrate assisted dimer assembly in both TvTIMs. We found that point mutants at the "ball" are only 39 and 29-fold less catalytically active than their corresponding wild-type counterparts, whereas Δloop 3 deletions are 1502 and 9400-fold less active. Point and deletion mutants dissociate into stable monomers. However, point mutants assemble as catalytic competent dimers upon binding of the transition state substrate analog PGH, whereas loop 3 deletions remain monomeric. A comparison between crystal structures of point and loop 3 deletion monomeric mutants illustrates that the catalytic residues in point mutants and wild-type TvTIMs are maintained in the same orientation, whereas the catalytic residues in deletion mutants show an increase in thermal mobility and present structural disorder that may hamper their catalytic role. The high enzymatic activity present in monomeric point mutants correlates with the formation of dimeric TvTIMs upon substrate binding. In contrast, the low activity and lack of dimer assembly in deletion mutants suggests a role of loop 3 in promoting the formation of the active site as well as dimer assembly. Our results suggest that in TvTIMs the active site is assembled during dimerization and that the integrity of loop 3 and ball and socket residues is crucial to stabilize the dimer.
Asunto(s)
Palabras clave

Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Trichomonas vaginalis / Triosa-Fosfato Isomerasa / Secuencia de Bases / Proteínas Protozoarias / Eliminación de Secuencia / Ácidos Hidroxámicos Idioma: En Revista: Biochim Biophys Acta Proteins Proteom Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: México

Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Trichomonas vaginalis / Triosa-Fosfato Isomerasa / Secuencia de Bases / Proteínas Protozoarias / Eliminación de Secuencia / Ácidos Hidroxámicos Idioma: En Revista: Biochim Biophys Acta Proteins Proteom Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: México