CTCF-Mediated Chromatin Loops between Promoter and Gene Body Regulate Alternative Splicing across Individuals.

Ruiz-Velasco, Mariana; Kumar, Manjeet; Lai, Mang Ching; Bhat, Pooja; Solis-Pinson, Ana Belen; Reyes, Alejandro; Kleinsorg, Stefan; Noh, Kyung-Min; Gibson, Toby J; Zaugg, Judith B

Ruiz-Velasco, Mariana; Kumar, Manjeet; Lai, Mang Ching; Bhat, Pooja; Solis-Pinson, Ana Belen; Reyes, Alejandro; Kleinsorg, Stefan; Noh, Kyung-Min; Gibson, Toby J; Zaugg, Judith B.

Afiliación

Ruiz-Velasco M; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Kumar M; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Lai MC; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Bhat P; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Solis-Pinson AB; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Reyes A; Genome Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Kleinsorg S; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Noh KM; Genome Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Gibson TJ; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany.
Zaugg JB; Structural and Computational Biology, European Molecular Biology Laboratory, 69117 Heidelberg, Germany. Electronic address: judith.zaugg@embl.de.

Cell Syst ; 5(6): 628-637.e6, 2017 12 27.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29199022

Asunto(s)

Factor de Unión a CCCTC/genética; Cromatina/metabolismo; Regulación de la Expresión Génica; Empalme Alternativo; Quinasa de Punto de Control 2/genética; Quinasa de Punto de Control 2/metabolismo; Cromatina/genética; Biología Computacional; Exones/genética; Genoma; N-Metiltransferasa de Histona-Lisina/genética; N-Metiltransferasa de Histona-Lisina/metabolismo; Humanos; Variaciones Dependientes del Observador; Regiones Promotoras Genéticas/genética; Unión Proteica; Proteínas Serina-Treonina Quinasas/genética; Proteínas Serina-Treonina Quinasas/metabolismo; Proteínas Tirosina Quinasas/genética; Proteínas Tirosina Quinasas/metabolismo; Transducción de Señal/genética; Estrés Fisiológico/genética; Relación Estructura-Actividad

Palabras clave

3D organization; CTCF; alternative exon usage; alternative splicing; chromatin loops; chromatin structure; gene regulation; genetic variation

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Cromatina / Regulación de la Expresión Génica / Factor de Unión a CCCTC Límite: Humans Idioma: En Revista: Cell Syst Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

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