TraRECo: a greedy approach based de novo transcriptome assembler with read error correction using consensus matrix.

Yoon, Seokhyun; Kim, Daeseung; Kang, Keunsoo; Park, Woong June

Yoon, Seokhyun; Kim, Daeseung; Kang, Keunsoo; Park, Woong June.

Afiliación

Yoon S; Department of Electronics Eng., College of Engineering, Dankook University, Yongin-si, Korea.
Kim D; Department of Microbiology, College of Natural Sciences, Dankook University, Cheonan-si, Korea.
Kang K; Department of Microbiology, College of Natural Sciences, Dankook University, Cheonan-si, Korea. kangk1204@dankook.ac.kr.
Park WJ; Department of Molecular Biology, College of Natural Sciences, Dankook University, Cheonan-si, Korea.

BMC Genomics ; 19(1): 653, 2018 Sep 04.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30180798

Asunto(s)

Biología Computacional; Células Madre Embrionarias/metabolismo; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Programas Informáticos; Transcriptoma; Animales; Células Madre Embrionarias/citología; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Ratones

Palabras clave

RNA-Seq; consensus matrix; de novo transcriptome assembly; greedy approach; read error correction

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Análisis de Secuencia de ADN / Biología Computacional / Células Madre Embrionarias / Transcriptoma Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2018 Tipo del documento: Article

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