SARS-CoV-2 Phylogenetic Analysis, Lazio Region, Italy, February-March 2020.

Bartolini, Barbara; Rueca, Martina; Gruber, Cesare Ernesto Maria; Messina, Francesco; Carletti, Fabrizio; Giombini, Emanuela; Lalle, Eleonora; Bordi, Licia; Matusali, Giulia; Colavita, Francesca; Castilletti, Concetta; Vairo, Francesco; Ippolito, Giuseppe; Capobianchi, Maria Rosaria; Di Caro, Antonino

Bartolini, Barbara; Rueca, Martina; Gruber, Cesare Ernesto Maria; Messina, Francesco; Carletti, Fabrizio; Giombini, Emanuela; Lalle, Eleonora; Bordi, Licia; Matusali, Giulia; Colavita, Francesca; Castilletti, Concetta; Vairo, Francesco; Ippolito, Giuseppe; Capobianchi, Maria Rosaria; Di Caro, Antonino.

Emerg Infect Dis ; 26(8): 1842-1845, 2020 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32459984

ABSTRACT

ABSTRACT

We report phylogenetic and mutational analysis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 virus strains from the Lazio region of Italy and provide information about the dynamics of virus spread. Data suggest effective containment of clade V strains, but subsequently, multiple waves of clade G strains were circulating widely in Europe.

Asunto(s)

Betacoronavirus/genética; Infecciones por Coronavirus/epidemiología; Infecciones por Coronavirus/transmisión; Pandemias; Filogenia; Neumonía Viral/epidemiología; Neumonía Viral/transmisión; ARN Viral/genética; Adulto; Anciano; Betacoronavirus/clasificación; Betacoronavirus/patogenicidad; Líquido del Lavado Bronquioalveolar/virología; COVID-19; Prueba de COVID-19; Técnicas de Laboratorio Clínico/métodos; Infecciones por Coronavirus/diagnóstico; Infecciones por Coronavirus/virología; Femenino; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Hospitalización; Humanos; Italia/epidemiología; Masculino; Persona de Mediana Edad; Mutación; Nasofaringe/virología; Neumonía Viral/diagnóstico; Neumonía Viral/virología; Estudios Prospectivos; Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa; SARS-CoV-2; Índice de Severidad de la Enfermedad; Factores de Tiempo

Palabras clave

COVID-19; Italy; SARS-CoV-2; coronavirus disease; full genome sequence; phylogenetic tree; respiratory infections; severe acute respiratory syndrome coronavirus 2; viruses

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Filogenia / Neumonía Viral / ARN Viral / Infecciones por Coronavirus / Pandemias / Betacoronavirus Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Observational_studies / Risk_factors_studies Límite: Adult / Aged / Female / Humans / Male / Middle aged País/Región como asunto: Europa Idioma: En Revista: Emerg Infect Dis Asunto de la revista: DOENCAS TRANSMISSIVEIS Año: 2020 Tipo del documento: Article

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