An efficient single-cell transcriptomics workflow for microbial eukaryotes benchmarked on Giardia intestinalis cells.

Onsbring, Henning; Tice, Alexander K; Barton, Brandon T; Brown, Matthew W; Ettema, Thijs J G

Onsbring, Henning; Tice, Alexander K; Barton, Brandon T; Brown, Matthew W; Ettema, Thijs J G.

Afiliación

Onsbring H; Department of Cell and Molecular Biology, Science for Life Laboratory, Uppsala University, 75123, Uppsala, Sweden.
Tice AK; Department of Biological Sciences, Mississippi State University, Starkville, Mississippi State, USA.
Barton BT; Department of Biological Sciences, Mississippi State University, Starkville, Mississippi State, USA.
Brown MW; Department of Biological Sciences, Mississippi State University, Starkville, Mississippi State, USA.
Ettema TJG; Department of Cell and Molecular Biology, Science for Life Laboratory, Uppsala University, 75123, Uppsala, Sweden. thijs.ettema@wur.nl.

BMC Genomics ; 21(1): 448, 2020 Jun 29.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32600266

Asunto(s)

Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Giardia lamblia/genética; Análisis de la Célula Individual/métodos; Regulación de la Expresión Génica; Proteínas Protozoarias/genética; Análisis de Secuencia de ARN; Flujo de Trabajo

Palabras clave

Giardia intestinalis; Microbial diversity; Microbial eukaryotes; Protists; RNAseq; Single cell genomics; Single-cell RNA sequencing; Smart-seq2; Transcriptome; Transcriptomics

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Giardia lamblia / Perfilación de la Expresión Génica / Análisis de la Célula Individual Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Suecia

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